Nature:胰腺导管腺癌的"基因复印机":染色体外DNA如何改写肿瘤生存法则
《Nature》杂志研究发现,PDAC 中 ecDNA 携带癌基因 MYC,通过复制、重组等操控基因,使癌细胞耐药、转移,研究还发现相关抑制剂,为抗癌治疗带来新方向。
生物探索 - 胰腺导管腺癌,ecDNA - 2025-03-18
四代EGFR-TKI:应对非小细胞肺癌C797S突变等耐药机制的新希望
第四代 EGFR TKI 的开发受到极大关注,因为这些药物有可能抑制第三代 EGFR TKI 耐药 NSCLC 患者中常见的耐药突变。
苏州绘真医学 - 非小细胞肺癌,EGFR-TKI - 2025-01-03
Nature:小环大威力:癌症中的脱缰野马ecDNA(染色体外DNA)
12 月 18 日 Nature 报道研究用新实验模型模拟染色体外 DNA(ecDNA)形成和作用,揭示其致癌潜力,包括促进细胞增殖、与肿瘤进化相关等,为癌症治疗带来新方向。
生物探索 - 癌症治疗,ecDNA - 2024-12-27
三篇Nature同期独立发表,揭秘ecDNA的起源、遗传和传播致癌特性
Nature 同期三篇论文探讨染色体外 DNA,包括其起源及影响、在肿瘤细胞中的协同遗传机制,以及潜在治疗靶点,为癌症治疗提供新思路。
测序中国 - 癌症治疗,染色体外DNA - 2024-11-23
Nat Commun:中科大瞿昆/郭闯团队对染色体外环状DNA算法性能进行系统评估
中国科大瞿昆、郭闯团队发文,用模拟和真实数据集评估 7 种 eccDNA 检测算法及 7 种实验方法性能,确定最佳检测方法,为科研人员选择合适研究方法提供依据,助力高效检测新方法开发。
测序中国 - 检测方法,染色体外环状DNA - 2024-11-15
NBT:任兵团队开发新型高通量单细胞染色质构象分析技术Droplet Hi-C,填补异质组织染色质分析的关键空白
研究团队介绍了一种高度可扩展的、基于液滴的单细胞Hi-C方法——Droplet Hi-C,它可使用商业微流体装置在液滴中进行高通量单细胞染色质构象分析。
测序中国 - 高通量单细胞染色质构象分析,Droplet Hi-C - 2024-11-05
Nat Genet:基于WGS数据绘制癌症进展过程中ecDNA扩增图谱,揭示抗癌新靶点
该研究表明ecDNA在癌症进展和转移过程中为肿瘤提供了竞争优势。
测序中国 - 抗癌,ecDNA - 2024-11-03
中国科大瞿昆团队《自然·通讯》:实现染色体外环状DNA检测方法的系统性评估
瞿昆教授课题组评估 7 种 eccDNA 分析算法及 7 种实验建库方法,Circle-Map 等在不同测序数据中有优势,Circle-Seq-LR 适用于特定 eccDNA 检测,研究提供资源助研究
BioMed科技 - eccDNA,染色体外环状DNA - 2024-10-30
Nat Commun:单细胞水平检测染色体外环状DNA多样性及复杂性的新工具scCircle-seq
研究团队开发并验证了Circle-seq的单细胞应用scCircle-seq,该方法适用于非固定和固定的细胞或细胞核,包括从肿瘤活检组织中提取的细胞核。
测序中国 - Circle-seq,eccDNA - 2024-03-23
中国肝癌图谱,登上Nature!
研究者进行了体外和体内实验,表明纤维蛋白原α链作为编码和非编码驱动基因的候选者,调节了HCC的进展和转移。这项CLCA研究描绘了中国个体HCC的详细基因组景观和进化历史,提供了重要的临床意义。
BioMed科技 - 肝细胞癌,HCC,CLCA - 2024-02-17
读书报告 | 阻断基因组不稳定性预防黑色素瘤对MAPK抑制剂获得性耐药
本文提供给我们一个关键的治疗思路,即靶向基因组不稳定性的起因能够预防获得性耐药。
iCombo - 黑色素瘤,MAPK抑制剂 - 2023-12-27
Nature Genet:髓母细胞瘤中的ecDNA:癌基因扩增与预后关联分析
使用先进的计算方法和测序技术,深入理解ecDNA在髓母细胞瘤中的作用,包括它如何影响肿瘤的生物学特性、治疗反应和患者的预后。
儿童肿瘤前沿 - 髓母细胞瘤,ecDNA - 2023-12-07
Cell Report:数量相差近3个数量级!WGS数据分析全面表征不同儿童脑肿瘤类型体细胞SV特征
研究团队分析了PBTA中744个儿童脑肿瘤样本的全基因组序列,共检测到13,199个高置信度的体细胞SV;进一步分解简单和复杂SV特征以推断其突变机制,发现不同肿瘤类型的SV特征存在巨大的异质性。
测序中国 - 脑癌,儿童脑肿瘤,结构变异,全基因组序列 - 2023-11-19
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