液体活检 肺癌检测 孤儿非编码RNA
2024-12-12发表于上海
#肺癌检测# 肺癌的早期发现可以提高治疗的有效性和患者的存活率,但相关筛查依从性往往很低。以循环肿瘤DNA(ctDNA)为基础的液体活检对早期肺癌的敏感性较低(55%-57%)。虽然表观基因组分析利用DNA甲基化的细胞类型特异性或DNA片段化模式,提高了基于突变模式的总体敏感性,但由于DNA脱落有限,对早期和较小肿瘤的敏感性仍然很低。近期的表观基因组学研究报告了更高灵敏度的肺癌检测,但这种增益通常是以较低的特异性为代价。
癌症中RNA调控机制的整体破坏也可能导致正常组织中出现不常见RNA片段及其稳定性。2018年,美国加州大学旧金山分校的Hani Goodarzi团队发现了一种新的癌症小RNA,称为孤儿非编码RNA(oncRNA),它们是癌症特异性基因组重编程的结果。研究显示,oncRNA含量丰富、稳定,并由活的癌细胞主动分泌到血液中,这与ctDNA相反。oncRNA的活跃表达和分泌可以在液体活检中发现早期癌症和亚型分层。此外,研究团队认为,变分自编码器的生成能力能够学习基于血液的生物标志物的稳健和可泛化的特征,因此开发了双臂半监督多输入变分自动编码器Orion,用于oncRNA的液体活检应用。
2024-12-14发表于浙江省
2024-12-12发表于上海