期刊阅读
Nature Methods：Paired-Damage-seq：同步解析DNA损伤与基因表达
3 月 24 日《Nature Methods》研究开发 Paired-Damage-seq 技术，能在单细胞水平同时分析 DNA 损伤与基因表达。
朱晨旭最新Nature Methods：单细胞DNA损伤检测新方法
该论文开发了Paired-Damage-seq技术，实现了单细胞层面上同时解析氧化性DNA损伤、单链DNA断裂（SSBs）及转录组。
Nature Methods：scNET，细胞版"人际关系管理"：精准医疗迈入基因社交调控时代
《Nature Methods》的scNET技术融合单细胞RNA测序与蛋白质相互作用网络，解决单细胞数据 “虚假零值” 问题，大幅提升基因功能解码、细胞分群及通路分析的精准度，为疾病诊疗带来变革。
Nature Methods：癌症治疗大翻盘：长读长测序揭开73%漏诊的致命靶点
《Nature Methods》研究发现传统基因检测技术或遗漏 73% 关键信息，纳米孔长读长测序技术优势显著，能精准定位靶点，为癌症治疗等带来新契机。
Nature Methods：当显微镜遇见AI：Spotiphy如何让每个细胞"开口说话"？
空间转录组学曾困于分辨率与信息量矛盾，Spotiphy 技术融合多数据突破此局。其在阿尔茨海默病、乳腺癌等研究中发现新细胞亚群与空间模式，能预测未捕获细胞，带来研究范式革新。
Nature Methods：颠覆传统模型！cell2fate破解细胞命运“动态密码”
单细胞 RNA 测序中的 RNA 速率技术面临困境，cell2fate 通过线性化 ODE 分解和贝叶斯模型破局。它在多数据集表现优异，还能解析疾病机理、实现时空分析，未来应用前景广阔。
Nature Methods：窥探生命的分子之舞：PTEN活体成像技术开启神经科学新纪元
PTEN 蛋白对细胞调控至关重要，其功能异常与多种疾病相关。研究利用 FRET 原理将其改造成生物传感器，实现活体组织 PTEN 动态监测，技术有突破，未来应用前景广。
Nature Methods：活细胞中的蛋白质如何“飙车”？新型显微镜技术揭秘分子世界的高速运动
这项技术突破不仅让研究人员首次在生理条件下全景式观测蛋白质网络，更开创了溶液单分子追踪、双色荧光成像、超分辨STORM等多模态研究先河。
Nature Methods：当细胞开始“自白”：解码癌症基因的双面叙事
这项技术如同给细胞核安装“双通道监听器”，首次实现从同一细胞核中同步捕获全基因组DNA变异和全转录组RNA表达。
Nature Methods：蛋白质复合物研究的新利器：Foldseek-Multimer
随着AlphaFold等预测工具的不断进步，预测蛋白质复合物的三维结构变得越来越精确，而Foldseek-Multimer的出现，更加加速了对这些预测结果的验证和应用。
Nature Methods：探索RNA编辑的力量：从基础研究到临床应用
RNA 编辑是 RNA 分子修饰过程，与 DNA 编辑不同，具暂时性、低副作用特点。ADAR 酶起关键作用，技术不断进展，在多疾病治疗有潜力，虽面临挑战，但前景广阔。
Nat Methods：人类生物分子图谱计划（HuBMAP）新进展：基于多模态数据深度整合，实现3D人类参考图谱多维升级
2018 年启动的 HuBMAP 旨在构建人体综合参考模型。团队明确标准，用技术构建第六版 HRA v2.0，开发工具，展示其在肺、肠道研究中的应用价值。
Nature Methods：从数据洪流到精准测绘：ACE重新定义全脑神经元分析
该研究不仅展示了ACE在多个神经科学应用中的卓越表现，还通过冷诱导食物觅食实验和运动实验，证明了ACE能够揭示以往难以检测的局部神经元活动模式。
Nature Methods：细胞形态学图谱：解锁基因功能的新钥匙
通过整合光学成像和高通量数据分析，该研究为探索基因与细胞功能的关系提供了一种具有成本效益且易于扩展的方法。这种创新技术不仅突破了传统分析方法的限制，还为未来在不同生理和疾病背景下的深入研究奠定了基础。
Nature Methods：“等深度”模型重塑空间生物学格局：深度学习与空间转录组学的完美结合
研究团队开发 GASTON 算法，结合无监督深度神经网络与可解释性算法，解决空间转录组学数据稀疏难题，解析多种生物样本基因表达模式，为疾病研究和精准医疗提供支持。
Nature Methods：如何利用温度精准操控细胞？细胞命运调控的新思路
这一研究不仅让我们重新审视温度作为生物学调控工具的潜力，也为未来的生物技术和医学应用提供了强大的新方向。
Nature Methods：单细胞多模态测序的未来：UDA-seq如何引领新革命？
单细胞RNA测序技术有局限，多模态单细胞测序技术成为热点却面临难题。UDA-seq技术通过两轮索引标记，提升通量、降低成本、增强样本兼容性，在多领域研究展现优势，为生物学和医学研究开辟新可能。
Nature子刊：中国医学科学院叶子璐等提出了一个名为Chip-Tip的高灵敏度单细胞蛋白质组学工作流程！
该研究提出了一个名为Chip-Tip的高灵敏度SCP工作流程，在单个HeLa细胞中识别超过5000种蛋白质。
Nature Methods：无标记代谢成像的未来：URV-SRS技术的深远影响
随着URV-SRS技术的不断发展和完善，它有望成为细胞代谢研究和精准医学领域中的一项重要工具，为我们揭开细胞内复杂的代谢网络提供更加清晰的视野。
Nature Methods：Chip-Tip技术：突破单细胞蛋白质组学研究瓶颈的革命性进展
单细胞蛋白质组学为生命科学研究带来机遇，但面临技术挑战。“Chip-Tip” 方法提升分析灵敏度与通量，可深度分析蛋白质及翻译后修饰，在多领域有应用潜力，未来需克服多方面挑战。
