Heliyon:通过生物信息学和分子对接,探索溃疡性结肠炎与银屑病的共同机制,预测治疗性天然化合物
2024-09-26 紫菀款冬 MedSci原创 发表于上海
本研究阐明银屑病(PS)和溃疡性结肠炎(UC)的共同生物学机制,并预测治疗这两种疾病的有效天然化合物。
背景:既往研究表明银屑病(PS)和溃疡性结肠炎(UC)之间存在潜在的相关性。然而,探索这两种疾病的共同机制的研究仍然有限。目前的治疗主要包括使用免疫抑制药物,这可能导致潜在的副作用和耐药性。中药治疗UC和PS疗效良好,副作用少。该研究旨在阐明UC和PS的共同生物学机制,并预测治疗这两种疾病的有效天然化合物。
方法:从基因表达综合数据库中收集与UC和PS相关的差异表达基因并进行验证。利用STRING数据库构建蛋白-蛋白相互作用网络,帮助鉴定核心靶点。利用基因本体和京都基因与基因组百科数据库分析鉴定的核心靶点的功能和基因组富集程度。采用CIBERSORT方法评估核心靶点与免疫细胞的相关性。从Coremine和TCMSP数据库中筛选出具有潜在治疗价值的化合物,通过分子对接预测其治疗效果。
结果:在UC和PS中,鉴定了20个共同的核心靶点,其中基质金属蛋白酶9 (MMP9)、基质金属蛋白酶1 (MMP1)、分化簇274 (CD274)、C-X-C基序趋化因子配体10 (CXCL10)和拓扑异构酶II α (TOP2A)是这两种疾病之间最相关的靶点。
UC和PS中巨噬细胞和树突状细胞水平升高,其中CXCL10与巨噬细胞的关系最密切。UC和PS具有共同的信号通路,包括IL-17、TNF和趋化因子信号通路等。分子对接显示,槲皮素、黄芩苷、鸢尾酮、吴茱萸次碱、表没食子儿茶素-3-没食子酸酯等具有作为治疗这两种疾病的天然化合物的潜力。
结论:MMP9、MMP1和CXCL10是UC和PS炎症通路中的中心介质,它们通过触发细胞因子和趋化因子激活,导致组织损伤,从而建立了共同的机制,并将其定位为这两种疾病的有希望的治疗靶点。槲皮素、黄芩苷、表没食子儿茶素-3-没食子酸酯等化合物可能是治疗这两种疾病的关键药物。这些发现表明,通过探索共同的机制和预测治疗UC和PS的有希望的天然化合物,治疗策略的潜在进步和患者护理的加强。
原始出处:
Yang Y, Gong Z, Yang J, et al. Exploring shared mechanisms between ulcerative colitis and psoriasis and predicting therapeutic natural compounds through bioinformatics and molecular docking. Heliyon. 2024;10(18):e37624. Published 2024 Sep 7. doi:10.1016/j.heliyon.2024.e37624
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