Nature Methods:从序列到结构:RhoFold+深度学习模型实现RNA 3D预测的高效革命
RNA 结构研究因实验局限而倚重计算方法,RhoFold + 应运而生,其整合语言模型与深度学习,在架构、性能评估、优势应用等多方面表现卓越,推动 RNA 生物学发展。
生物探索 - 深度学习,RhoFold+,RNA结构预测 - 2024-11-25
Preprints: 利用对外源性RNA的转录反应预测RNA病毒的广谱抗病毒药
当与疫苗抗原同时接种时,病毒入侵是原核细胞和真核细胞所面临的最大挑战之一。对抗病毒感染的各种机制在所有生命形式中都得到了进化。
转化医学网 - 外源性RNA - 2020-03-31
Cell:科学家揭示埃博拉病毒和其它RNA病毒的关键结构蛋白
埃博拉病毒和狂犬病毒都是两种人类的致死性病原体,其同属于RNA病毒类别,而且其在宿主体内常常会共享一套常用的策略来进行病毒基因组的复制,而其它同类型的病毒包括马尔堡病毒、麻疹病毒、腮腺炎病毒以及水疱性口炎病毒等
生物谷 - 埃博拉病毒,RNA病毒 - 2015-07-07
CLIN CANCER RES:干扰素γ信使RNA特征可以预测患者结局
CLIN CANCER RES近期发表了一篇文章, 研究durvalumab的预测性生物学标志。
MedSci原创 - 非小细胞肺癌,尿路上皮癌,信使RNA,干扰素γ - 2018-08-28
Nature:从二维到三维:RNA分子动态结构的全新解析之路
本文介绍 HORNET 方法,阐述其因应 RNA 结构研究难题而生,结合 AFM 与 DNN 优势实现溶液环境下单分子 RNA 多构象解析,展示应用实例及独特价值,探讨其在多领域的未来潜力。
生物探索 - 深度神经网络,原子力显微镜 - 2024-12-26
J Cell Biochem:长非编码RNA预测膀胱上皮肿瘤患者生存研究
大量的研究表明了长非编码RNA(lncRNA)在膀胱上皮恶性肿瘤的发展和恶化中具有重要的作用。
MedSci原创 - 膀胱癌,长非编码RNA,预后 - 2019-08-08
Nature:不止蛋白质结构!AlphaFold3可高精确度预测生物分子结构及相互作用
推出了全新的预测工具AlphaFold3(AF3),这是一个能够高精度预测蛋白质数据库(PDB)内几乎所有分子类型复合物的模型,包括准确预测蛋白质、DNA、RNA、小分子配体结构以及其相互作用模式。
测序中国 - AlphaFold3,生物分子结构 - 2024-05-25
Nature Methods:解码基因调控新机制:系统性发现人类转录组中的RNA结构开关
研究开发 SwitchSeeker 方法用于鉴定人类转录组中的 RNA 结构开关,在 RORC 转录本中验证,扩展对基因调控中 RNA 开关的理解,为未来研究奠定基础。
生物探索 - 基因调控,RNA结构开关,SwitchSeeker,人类转录组,RORC - 2024-07-18
European Radiology:CT在预测TAVI术患者瓣膜结构变性方面的应用
现阶段,计算机断层扫描(CT)已成为TAVI计划的重要组成部分,提供了详细的患者特定的解剖特征。
MedSci原创 - TAVI,主动脉瓣狭窄 - 2022-07-15
Mol Cell:A型流感病毒RNA聚合酶复合体三维冷冻电镜结构揭示
1月22日,Molecular Cell 杂志在线发表了流感病毒RNA聚合酶复合体的结构和功能研究方面的研究成果。 流感病毒属负链RNA病毒,有A、B和C型三种类型。
中国科学院生物物理研究所 - RNA聚合酶,A型流感病毒,王宏伟 - 2015-01-28
基于RNA-Seq的长非编码RNA(lncRNA)预测
随着新一代生物技术和生物信息学的发展,研究发现在真核生物转录组中存在大量长非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA),而这些lncRNA可能在基因表达调控过程中起到关键性的功能作用 当前lncRNA研究主要采用高通量RNA-Seq测序技术,并通过生物信息学方法对测序数据进行处理和分析,以挖掘其中lncRNA的序列、结构、表达及功
生物化学与生物物理学进展 - RNA-Seq,长非编码RNA - 2014-01-03
长链非编码RNA(lncRNA)靶标数据库及预测软件汇总
国内外长链非编码RNA的研究刚刚兴起,但已有相当多数据库资源供大家参考。(1) ChIPBase: 提供长链非编码RNA的表达图谱和转录调控的全面鉴定和注释。整合了高通量的RNA-seq鉴定的lncRNA及其表达图谱和ChIP-Seq实验技术鉴定的转录因子结合位点。
MedSci原创 - lncRNA,数据库,软件 - 2014-01-10
Nature:施一公解析Lsm蛋白质复合物晶体结构 揭示RNA剪接机制
清华大学施一公研究组在《自然》发表最新论文,阐述Lsm蛋白质复合物特异性识别剪切体U6 RNA的分子机制。图示Lsm2-8复合物与U6 RNA的特异性识别。
MedSci原创 - 施一公,蛋白质,RNA - 2013-11-20
JACC:透析患者心脏结构异常,右心室收缩功能不全独立预测死亡
急性透析质量倡议工作组提出了超声心动图(ECHO)在透析患者中的心脏结构异常(SHD)标准。SHD与重要的患者的预后的关联并不明确。
MedSci原创 - 透析,心脏结构异常,右心室收缩功能不全,死亡 - 2016-03-09
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