论文解读丨黄茉莉教授团队：管腔相关转录程序对浸润性粘液肺腺癌至关重要

浸润性粘液肺腺癌（IMA）是肺腺癌的一种侵袭性亚型，常携带“不可成药”的KRAS突变，目前缺乏针对性的治疗方案。之前的研究表明，不同的上皮起源肿瘤或倾向于管腔特征的基因表达，或倾向于基底特征的基因表达，从而影响其治疗反应。然而，IMA的细胞倾向及相关转录程序的作用还未得到研究。

苏州大学黄茉莉教授团队在本刊发表了题为“Transcriptional programs associated with luminal play a vital role in invasive mucinous lung adenocarcinoma”的研究快讯，揭示了管腔相关转录程序在IMA中的关键作用。

1、IMA具有管腔倾向

该研究通过PAM50亚型分析发现，不论是组织还是单细胞水平，IMA均具有显著高于肺腺癌的管腔倾向。此外，还在多个数据集中发现了管腔标志物FOXA1的高表达，进一步论证了IMA的管腔倾向。

2、IMA在ECM-receptor interaction通路富集

研究发现，IMA与肺腺癌的差异表达基因富集于ECM-receptor interaction通路。细胞通讯分析显示，IMA细胞和M2巨噬细胞通过该通路中的SPP1-CD44基因通讯。此外，差异组蛋白修饰分析也表明，IMA在细胞质外基质（ECM）相关通路富集。

3、以FOXA1为核心的管腔相关转录程序

CHIP-Seq研究发现，管腔标志物FOXA1可能结合到EHF的启动子附近增强其染色质开放性。而EHF不仅可以结合到ECM-receptor interaction通路基因ITGB4的TSS区域促进其开放性和表达水平，还可以增强粘液产生相关基因MUC5AC/B的表达。

4、IMA的潜在治疗靶点

研究发现，ITGB4在约80%的IMA数据集中显著上调。Cox风险回归模型指出ITGB4是IMA的生存风险因素。同时，CRISPR基因敲除实验数据表明，ITGB4的敲除有助于抑制IMA细胞系（NCI-H292）的生存，是潜在的治疗靶点。

图1 IMA中的管腔相关转录程序 (FOXA1-EHF-ITGB4) 及其下游通路（ECM-receptor interaction）

总之，这项研究揭示了管腔相关转录程序（FOXA1-EHF-ITGB4），及其下游通路ECM-receptor interaction（SPP1-CD44）在 IMA 中发挥重要作用，影响其免疫通讯、粘液产生和肿瘤风险。这一研究成果为IMA的治疗策略提供了新的理论依据和潜在靶点，有望为IMA患者带来更好的治疗前景。

文章来源

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https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352304224000758

引用这篇文章：

Zhang S, Jiang R, Wang C, et al. Transcriptional programs associated with luminal play a vital role in invasive mucinous lung adenocarcinoma. Genes Dis. 2025;12(2): 101278 .