CLIN CHEM:通过单分子分子逆转探针捕获和高通量测序能够准确诊断微卫星不稳定性
2018-04-11 MedSci MedSci原创
微卫星不稳定性(MSI)是肿瘤学中一种新兴的可操作表型,能够提示肿瘤对免疫检查点通路免疫治疗的反应。。但是,目前仍缺乏低成本,高度准确和可跨癌症类型普遍化的MSI诊断。研究人员使用单分子分子倒位探针(smMIPs)开发了一种针对MSI的泛癌信息的多种微卫星基因座靶向高通量测序方法。 研究人员设计了一个跨肿瘤类型的针对可提供信息111个位点的smMIP。同时利用smMIP介导的纠错技术开发了一
微卫星不稳定性(MSI)是肿瘤学中一种新兴的可操作表型,能够提示肿瘤对免疫检查点通路免疫治疗的反应。。但是,目前仍缺乏低成本,高度准确和可跨癌症类型普遍化的MSI诊断。研究人员使用单分子分子倒位探针(smMIPs)开发了一种针对MSI的泛癌信息的多种微卫星基因座靶向高通量测序方法。 研究人员设计了一个跨肿瘤类型的针对可提供信息111个位点的smMIP。同时利用smMIP介导的纠错技术开发了一个分析框架,不需要输入匹配的正常材料可特异且灵敏地检测不稳定事件。 研究发现,使用合成的DNA混合物,smMIP对至少1%MSI阳性细胞敏感,并且在重复之间一致性很高。所鉴定的不稳定微卫星的部分可以以高准确度区分显示MSI的肿瘤与缺乏MSI的肿瘤,且敏感性和特异性分别为:直肠(100%诊断灵敏度和特异性),前列腺(100%诊断敏感度和特异性)和子宫内膜癌(95.8%诊断敏感性和100%特异性)。MSI-PCR是目前用于MSI的分子诊断标准,对结直肠肿瘤同样有效,但在前列腺(81.8%的诊断敏感性和100%的特异性)和子宫内膜(75.0%的诊断敏感性和100 %特异性)肿瘤中有一定的假阴性。 研究表明
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