Can J Infect Dis Med Microbiol：新冠肺炎疫情期间监测在减少SARS-CoV-2冠状病毒变异株假阳性中的作用

背景：新冠肺炎仍处于疫情状态，是国际关注的突发公共卫生事件。与delta相比，omicron变异株被认为具有更短的系列间隔(2.2-3.5天)和更短的潜伏期(2.9-3天)。此外，它具有更高的二次攻击率，并已被证明可以逃避免疫监视。尽管变异体感染不太可能导致严重疾病和死亡，但这种特定的变异体很容易在个体之间传播。变异体的影响不应该被忽视，因为它具有更高的传播性，如果它在大量人群中传播，更多的人会患上严重的疾病。此外，国外一些国家已经观察到与omicron变异体相关的住院率和死亡率。在过去的两年里，中国一直在实施动态的零新型冠状病毒政策，以防止新的疫情爆发。然而，最近几天，国内疫情明显加剧，对这一政策提出了复杂的挑战。新型冠状病毒的实验室检测在确定传染源和协助政府采取对策方面发挥着关键作用。为进一步提高核酸检测质量，发现潜在问题，国务院联防联控机构已向发生疫情的省份派出监督检查组，开展针对问题的监督检查。

2022年3月13日，泉州市丰泽区重点人群常规筛查中，9人检测新冠肺炎阳性。所有阳性病例都是为同一家酒店工作的酒店员工。阳性样本的基因组测序揭示了一个从Omicron BA.2突变体进化而来的亚系，与中国鉴定的其他已知序列相比，没有发现高度同源的序列。对此，省卫生委员会向泉州市的高危地区派出了监督检查组。Te团队对操作手册的合规性、个人防护、质量控制和交叉污染进行了监督检查。这些检查的目的是提高质量控制和消除发布不准确报告的可能性。在部署监督检查小组后的第四天，105支样本管检测呈阳性，第五天，159支样本管检测呈阳性。问题是报告中是否有假阳性事件。对37项外部质量评估的审查发现，检测RNA病毒的假阳性率从0.6%到8.1%不等。假阳性结果会对患者的精神和身体健康产生负面影响，误诊会导致医疗资源管理不善。据我们所知，还没有关于新型冠状病毒核酸检测监督检查评估的报告。

目的：Tis研究旨在评估监督检查是否可以减少假阳性事件。

方法：Te小组对参与大规模筛查的实验室进行了现场检查，记录了任何违反规则的情况。

结果：历城区、丰泽区和洛江区五轮人群筛查的阳性病例分别为23、173和4例。五轮大规模筛查的假阳性率分别为0.0099%、0.0063%、0.0018%、0.0006%和0%。研究还记录了七个选定实验室的违规数量分别为36、68、69、42、60、54和47。相应的假阳性率分别为0.0012%、0.0060%、0.0082%、0.0032%、0.0060%、0.0027%和0.0021%。研究发现假阳性率和违规次数之间呈正相关(r \u 0 .p > 0.005)，假阳性率与监督检查频率呈负相关(r \u 0 .P < 0.001)。

图1 医疗机构新型冠状病毒检测的假阳性率。

表1 真阳性和假阳性样品之间ORF1和N基因结果的比较

表2 七个实验室的违规分布

图2:违反规则和假阳性事件之间的关联。

图3:检查次数和假阳性率之间的关系。

结论：实验室的日常监督检查可以提醒实验室严格遵守标准程序，注重实验室质量控制，在一定程度上减少新型冠状病毒核酸检测中假阳性病例的发生。这项研究建议政府决策部门制定政策，安排专家进行日常监督检查，以改善实验室质量控制。

原文出处： Liu LL,  Zheng YH,  Zhang YQ,et al.The Role of Surveillance Inspections in Reducing False-Positives of SARS-CoV-2 Omicron Variants during the COVID-19 Epidemic.Can J Infect Dis Med Microbiol 2023;2023