Thromb Res：RNA测序发现与胶质母细胞瘤患者静脉血栓栓塞相关的基因和信号通路：病例对照研究
2023-11-03 刘少飞 MedSci原创 发表于德国
恶性胶质母细胞瘤患者患静脉血栓栓塞症（VTE）的风险很高。肿瘤内在特征被认为起到一定作用，但其潜在病理机制尚未完全理解。
研究背景：
癌症患者在癌症诊断后的第一年与没有癌症的个体相比，患静脉血栓栓塞症（VTE）的风险增加了九倍。此外，除了癌症本身的进展，血栓栓塞事件在接受化疗治疗的癌症患者中也是重要的死亡原因。特别是，恶性胶质母细胞瘤患者患VTE的风险大大增加（10-30%）。认为恶性胶质母细胞瘤中的肿瘤内在特征可能导致VTE，但确切的潜在病理机制仍未完全理解。在这项病例-对照研究中，通过比较患有VTE的恶性胶质母细胞瘤患者的23个肿瘤与没有VTE的23个恶性胶质母细胞瘤患者的基因表达谱，我们旨在识别与恶性胶质母细胞瘤患者VTE相关的基因或遗传机制。
研究目标：
通过使用下一代RNA测序（RNA-Seq），识别与恶性胶质母细胞瘤相关的VTE相关的肿瘤表达基因和信号通路。
研究方法：
采用不配对分析比较了23名患有VTE的恶性胶质母细胞瘤患者和23名没有VTE的患者的肿瘤基因表达谱。对前50个差异表达基因进行了“Ingenuity Pathway Analysis（IPA）”核心分析，以探讨相关功能和信号通路。根据完整的RNA-Seq数据，通过进行聚类分析确定了分子恶性胶质母细胞瘤亚型。
研究结果：
在19327个基因中，有1246个（6.4%）在患有VTE和没有VTE的恶性胶质母细胞瘤患者之间差异表达（未经校正的P < 0.05）。最高过表达的基因是GLI1，这是Sonic Hedgehog（Shh）信号通路中的经典靶基因（log2倍数变化：3.7；未经校正的P < 0.0001，校正后P = 0.219）。与之一致，Shh信号通路是与VTE相关的前列标准信号通路和过程之一。VTE患者中倾向性神经型恶性胶质母细胞瘤亚型的比例高于对照组。
研究结论：
Shh信号通路可能参与了恶性胶质母细胞瘤相关VTE的发展。
参考文献：
Kapteijn MY, Lanting VR, Kaptein FHJ, Guman NAM, Laghmani EH, Kuipers TB, Mei H, Goeman JJ, Mulder FI, van Duinen SG, Taphoorn MJB, Dirven L, Broekman MLD, van Es N, Klok FA, Koekkoek JAF, Versteeg HH, Buijs JT. RNA-sequencing to discover genes and signaling pathways associated with venous thromboembolism in glioblastoma patients: A case-control study. Thromb Res. 2023 Oct 29;232:27-34. doi: 10.1016/j.thromres.2023.10.018. Epub ahead of print. PMID: 37918288.
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