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Sci Transl Med:新机器学习方法ARTEMIS绘制人类癌症<font color="red">重复元件</font><font color="red">图谱</font>,助力癌症早期检测和组织溯源

Sci Transl Med:新机器学习方法ARTEMIS绘制人类癌症重复元件图谱,助力癌症早期检测和组织溯源

以上分析揭示了人类癌症重复元件图谱的广泛变化,并提供了一种无创检测和表征癌症的方法,这可能有利于癌症患者的早期检测和疾病监测。

测序中国 - 癌症,重复元件图谱 - 2024-04-24

Nature子刊:基于癌症患者血浆游离RNA(cfRNA)<font color="red">重复</font>序列<font color="red">元件</font>检测方法,助力诊断标志物开发及肿瘤分型

Nature子刊:基于癌症患者血浆游离RNA(cfRNA)重复序列元件检测方法,助力诊断标志物开发及肿瘤分型

研究团队开发了cfRNA转录组中重复元件的检测方法COMPLETE-seq,揭示了使用该RNA液体活检重复感知测序技术广泛表征cfRNA转录组的价值和实用性。

测序中国 - 癌症,cfRNA - 2023-09-19

​Cell:李蔚/崔亚团队首次建立串联<font color="red">重复</font>扩增的全基因组<font color="red">图谱</font>TR-gnomAD

​Cell:李蔚/崔亚团队首次建立串联重复扩增的全基因组图谱TR-gnomAD

美国加州大学李蔚教授和崔亚教授团队合作建立了第一个biobank级别的人类多种族TR扩增全基因组图谱TR-gnomAD,包含了来自不同祖源WGS样本的0.86百万个TR。

测序中国 - TR-gnomAD,全基因组图谱,基因组聚集数据库 - 2024-05-02

利用人体内的古老病毒治疗癌症,这项Cell论文成果获美国防部资助

利用人体内的古老病毒治疗癌症,这项Cell论文成果获美国防部资助

大多数前列腺癌是可治疗的,因此许多人不认为这是一个重大公共卫生问题。然而,当前列腺癌发生转移或对激素疗法产生耐药性时,就会变得致命。

“生物世界”公众号 - 癌症,古老病毒 - 2023-05-01

Cell Res :揭示节律蛋白延缓干细胞衰老及促进再生的新功能

Cell Res :揭示节律蛋白延缓干细胞衰老及促进再生的新功能

生物钟的调控机制在不同物种中高度保守,使生理和行为呈现出与外界24小时昼夜循环一致的节律性变化,从而维持机体组织和细胞生理活动的动态平衡。越来越多的证据显示,节律调控的失衡与衰老密切相关。

BioArt - 生物钟,节律蛋白,干细胞衰老,促进再生 - 2020-08-02

CELL:LSD1缺失增强肿瘤免疫原性

CELL:LSD1缺失增强肿瘤免疫原性

染色质调节因子在调控基因表达方面发挥着广泛的作用,并且,当其出现错误时可能导致癌症。

MedSci原创 - LSD1,肿瘤免疫 - 2018-06-27

Nat Commun发表人类单细胞长读长全基因组分析新方法,可为单细胞遗传变异提供新见解

Nat Commun发表人类单细胞长读长全基因组分析新方法,可为单细胞遗传变异提供新见解

长读长测序可提高单细胞遗传变异检测的性能,特别是检测单倍型、复杂结构变异和串联重复序列(TR);并证明从头重建部分人类T细胞基因组是可行的。

测序中国 - 长读长全基因组,单细胞遗传变异 - 2023-09-13

NAR:北京大学汤富酬团队利用单精子长读段基因组测序进行高精度单倍型分型

NAR:北京大学汤富酬团队利用单精子长读段基因组测序进行高精度单倍型分型

该研究开发了一种基于长读长的单精子基因组测序方法和相应的数据分析管道,可以准确地识别单个精子中的交叉事件和染色体水平的非整倍体,并有效地检测单个精子细胞中的SVs。

iNature - 基因组测序 - 2023-07-18

Genome Biology | 稳健、快速、低成本!INSERT-seq方法可对DNA整合特征进行高分辨率定位

Genome Biology | 稳健、快速、低成本!INSERT-seq方法可对DNA整合特征进行高分辨率定位

综上所述,INSERT-seq将基于扩增的富集、UMI扩增校正以及处理整合位点的计算框架相结合。

测序中国 - INSERT-seq方法,DNA整合特征,高分辨率定位 - 2022-11-28

Nature 子刊:浙江大学报道小鼠发育及成熟细胞<font color="red">图谱</font>

Nature 子刊:浙江大学报道小鼠发育及成熟细胞图谱

研究者比较了不同细胞谱系的分化特征,发现了跨谱系命运决定的共性调控因子。

网络 - 基因表达谱,成熟细胞,小鼠发育 - 2022-08-01

Nature:乳腺癌易感基因新位点

Nature:乳腺癌易感基因新位点

GWAS研究和大量的重复研究已经鉴定了79个和乳腺癌相关的位点,这在一定程度上解释了乳腺癌的家族风险。为了鉴定新的易感基

生物谷 - 乳腺癌,基因位点 - 2015-03-12

Nat Rev Genet. :环状RNA的合成与功能,与糖尿病、神经系统疾病、心血管疾病和癌症等疾病有关

Nat Rev Genet. :环状RNA的合成与功能,与糖尿病、神经系统疾病、心血管疾病和癌症等疾病有关

环状RNA(circular RNA,circRNA)是一种新兴的内源性非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA),是继microRNA (miRNA)以及long noncoding RNA (IncRNA)后非编码RNA家族中极具研究潜力的新成员。越来越多的研究表明,环状RNA具有种类丰富、结构稳定、序列保守以及细胞或组织特异性表达等特点。近年来,随着RNA研究技术的进步,研究者们

BioArt - 环状RNA,合成,功能,糖尿病,心血管,癌症 - 2019-11-09

Sci Transl Med:机器学习+扩增子片段组测序实现灵敏的癌症早期检测

Sci Transl Med:机器学习+扩增子片段组测序实现灵敏的癌症早期检测

研究发现,A-PLUS的部分功效可以归因于一个单一的特征——实体癌患者cfDNA中Alu元件的整体减少。

测序中国 - 机器学习,测序,癌症 - 2024-03-11

Science:解析CRISPR/Cas的分子机制

日前,来自美国蒙大拿州立大学,英国剑桥大学等机构的研究人员通过解析一种 CRISPR RNA导向监督复合物结构,揭示了 CRISPR 的组装分子机制,同时也为进一步了解靶标识别机制提供了新的信息。相关研究论文刊登在了近期出版的《科学》(Science)杂志上。CRISPR/Cas 是源于细菌及古细菌中的一种后天免疫系统,它可利用靶位点特异性的RNA指导 Cas 蛋白对靶位点序列进行修饰。自2013

生物360 - RISPR/Cas9,基因编辑 - 2014-08-08

甲基化DNA免疫共沉淀测序原理及简介(MeDIP-seq)

MeDIP-Seq(Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing)测序是基于抗体富集原理进行测序的全基因组甲基化检测技术,采用甲基化DNA免疫共沉淀技术,通过5'-甲基胞嘧啶抗体特异性富集 基因组上发生甲基化的DNA片段,然后通过高通量测序可以在全基因组水平上进行高精度的CpG密集的高甲基化区域研究。 研究人员可以利用MeDIP-Seq

MedSci原创 - 甲基化,免疫共沉淀 - 2014-02-05

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