Nat Commun:中科大瞿昆/郭闯团队对染色体外环状DNA算法性能进行系统评估
中国科大瞿昆、郭闯团队发文,用模拟和真实数据集评估 7 种 eccDNA 检测算法及 7 种实验方法性能,确定最佳检测方法,为科研人员选择合适研究方法提供依据,助力高效检测新方法开发。
测序中国 - 检测方法,染色体外环状DNA - 2024-11-15
中国科大瞿昆团队《自然·通讯》:实现染色体外环状DNA检测方法的系统性评估
瞿昆教授课题组评估 7 种 eccDNA 分析算法及 7 种实验建库方法,Circle-Map 等在不同测序数据中有优势,Circle-Seq-LR 适用于特定 eccDNA 检测,研究提供资源助研究
BioMed科技 - eccDNA,染色体外环状DNA - 2024-10-30
Nat Commun:单细胞水平检测染色体外环状DNA多样性及复杂性的新工具scCircle-seq
研究团队开发并验证了Circle-seq的单细胞应用scCircle-seq,该方法适用于非固定和固定的细胞或细胞核,包括从肿瘤活检组织中提取的细胞核。
测序中国 - Circle-seq,eccDNA - 2024-03-23
Nature Protocols | 张毅团队开发有效可重复的染色体外环状DNA纯化方法
染色体外环状DNA (Extrachromosomal circular DNA, eccDNA)在半个多世纪前被发现。
iNature - 环状DNA纯化 - 2022-12-24
PNAS:卢煜明团队PNAS发表新成果,在母体血浆中发现环状DNA
香港中文大学卢煜明(Dennis Lo)教授领导的研究团队,近日从孕妇血浆中鉴定出母亲和胎儿的环状游离DNA,为无创产前检测提供了一种新型的生物标志物。这项成果于1月3日发表在PNAS上。
转化医学网 - 母体,环状DNA,妊娠相关疾病 - 2020-01-09
Nat Gene:儿童癌症元凶,染色体外环状DNA?
随着时间的推移,癌症的发展与DNA缺陷的逐渐积累有关。因此,癌症被认为是一种与年龄有关的疾病。但是儿童为什么会患癌症呢?近日,由夏里特医学院和纪念斯隆-凯特琳癌症中心组成的一个国际研究小组发现,染色体外环状DNA可从基因组分离和整合,可能导致一些基因被破坏,促进儿童癌症的发展。同时研究人员首次绘制了环状DNA的详细图谱,并有望用于儿童癌症的诊断。该研究发表在近日的《Nature Genetics》
转化医学网 - 儿童,癌症 - 2019-12-18
Genome Med:林桐榆/岳家兴团队合作构建新型NK/T细胞淋巴瘤分子分型系统,助力精准临床诊疗
研究团队构建了一套新的NK/T细胞淋巴瘤分子分型系统(C0-C4),对应该分子分型系统各不同亚型的基因组突变及及临床预后特征,为今后的NK/T细胞淋巴瘤精准临床诊疗提供有价值的指导。
测序中国 - NK/T细胞淋巴瘤,分子分型系统 - 2024-04-19
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