Genome Bio:灵敏、快速的基因组污染检测新工具FCS-GX,可自动去除污染序列、提高数据质量
究团队开发了FCS-GX,其是NCBI外来污染筛查工具套件的一部分,经过优化,可识别和去除新基因组中的污染物序列。
测序中国 - FCS-GX,基因组污染 - 2024-03-25
circRNADb:首个汇总编码蛋白环状RNA的数据库
10月11日,Nature出版集团子刊Scientific Reports在线发表了南京医科大学Li Yan团队的一项重要环状RNA研究成果,介绍开发了首个汇总可编码蛋白的环状RNA的数据库:circRNADb(数据库网址:http://reprod.njmu.edu.cn/circrnadb)文中作者通过汇总整理,共收集了32914条人类外显子环状RNA记
circRNA 吉赛生物 - 环状RNA,环状RNA的数据库 - 2016-10-15
Nature、NEJM证明:最大人类基因变异数据库——ExAC,让医学少走弯路
8月17日,Nature封面介绍了至今为止世上最大人类基因变异数据库,该基因库凸显出若干误导罕见疾病的基因突变,以及可能对疾病扮演意想不到角色的其他突变。据报道,2年前由多达100人的研究团队建立了外显子组(exome)超过1000万变异的数据库。研究作者们编制的该数据库,利用来自20多个疾病研究的DNA数据进行分析。ExAC在2014年在网上公布,被查询了超过500万次。外显子组仅是人类基因组的
MedSci原创 - ExAC数据库,基因突变,基因诊断,外显子 - 2016-08-19
中科院:与美国同步共享5株2019新型冠状病毒基因组序列
中国科学院7日在官网上发文披露,国家生物信息中心(CNCB)/国家基因组科学数据中心(NGDC)首批自主收录的5株2019新型冠状病毒基因组序列实现与美国NCBI核酸数据库GenBank数据同步与共享。全文如下:国家生物信息中心(CNCB)/国家基因组科学数据中心(NGDC)首批自主收录的5株2019新型冠状病毒基因组序列实现与美国NCBI核酸数据库GenBank数据同步与共享。CNCB/NGDC
健康界 - 新型冠状病毒 - 2020-02-13
多国实施全基因组分析计划
由于基因测序可以探查与特定疾病相关的基因,该疗法正在成为日益受欢迎的诊断方法。英国计划到2017年对10万人进行基因组测序。美国加州一对龙凤胎出生后,他们的父母非常忧虑:两个婴儿不仅发育缓慢,而且肌肉松软无力。大脑扫描结果显示,男婴或存在大脑性麻痹;然而医生对造成女婴震颤和癫痫的原因却不清楚。一连串的检测均未能确诊两名婴儿的病因,当两名孩子5岁时,开始服用左旋多巴(用于治疗帕金森氏症的一种药物
生物谷 - 基因治疗,基因图谱 - 2015-09-08
Nucleic Acids Res:利用新的引物数据库快速检测和识别RNA病毒
在一项新的研究中,来自韩国大邱庆北科学技术院(Daegu Gyeongbuk Institute of Science and Technology, DGIST)的研究人员编制出一种综合性的新的遗传信息公共数据库这一数据库在抵抗潜在的未来流行病时应当将会是无价之宝。相关研究结果于2016年11月29日在线发表在Nucleic A
生物谷 - RNA病毒,引物 - 2017-01-04
【Nature】重大飞跃:人工智能预测几乎整个“蛋白质宇宙”!
这份前所未有的丰富数据,将帮助我们探索生命科学的无尽奥秘,并对研究生物学、医药领域提供巨大帮助。
网络 - 人工智能,蛋白质宇宙 - 2022-08-04
英国生物银行生成"最大的外显子组数据开放存取资源"
该数据库是基于50000名参与者的基因序列、在Regeneron Genetics Center生成的,是英国生物银行、GSK和Regeneron之间大规模合作的一个部分,目前已经成为"于人类健康记录密切相关的、全球最大的外显子序列开放数据库"。
MedSci原创 - 外显子组,开放数据库,药物发现 - 2019-03-12
全基因组重测序数据,十种主要分析方法全面介绍
通过高通量测序识别发现de novo的somatic和germ line 突变,结构变异-SNV,包括重排突变(deletioin, duplication 以及copy number variation)以及SNP的座位;针对重排突变和SNP的功能性进行综合分析;我们将分析基因功能(包括miRNA),重组率(Recombination)情况,杂合性缺失(LOH)以及进化选择与mutation
MedSci原创 - 全基因组,测序 - 2016-06-16
精确医学:建立在系统生物学基础上的未来医疗
吴家睿(中科院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所) 2015年初,美国总统奥巴马在美国国会做国情咨文报告时表示:“我希望这个消灭了天花、绘制出人类基因组图谱的国家可以引领一个新时代——一个在恰当时机提出正确治疗方法的时代。今晚,我将发起一项‘精确医学’倡议,让我们向治愈癌症与糖尿病等疾病更靠近一步,使每个人都可以得到让我们与家人保持健康所需要的个性化信息”。 这段讲话让
生命科学 - 精确医学,系统生物学 - 2015-05-06
把基因组上传到云端
近日,Google正式推出了Google Genomics,这一产品可以让科学家把基因组数据存储在云端,并对DNA序列进行研究和共享。其实从18个月前,Google就开始着手Google Genomics的建立了,包括会见科学家,以及搭建界面和应用程序接口。凭借这些,Google可以将DNA数据存储在自己的服务器集群上,并利用这些数据进行实验。其中用到的数据库技术与Google索引和用户
果壳网 - 基因治疗 - 2014-11-11
生物领域的大数据有多值钱?
36氪曾多次报道过这家基因技术公司,好吧,我们这么关心这家公司的原因也许是因为它的联合创始人之一Anne Wojcicki正是谷歌联合创始人Sergey Brin的妻子(分居了?)。目测我身边不少生科妹子(以及女性老师)都很羡慕她有一位有钱的丈夫可以为自己做实验买单。 言归正传,23andMe是一家好公司,Anne Wojcicki也被认为是一位好科学家。
36氪 - 大数据,生物领域 - 2015-01-09
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