Circle圆基因推出新一代消费级基因检测
由中国领先的创新型生物科技公司贝瑞基因和Prenetics联合投资的Circle圆基因，今天在北京举办的产品发布会上宣布推出新一代消费级基因检测产品。此次Circle圆基因推出的消费级基因检测产品采用最新的“WES全外显子组测序“技术，与目前消费级基因检测最常用的芯片检测技术相比，当消费者提供同样的口腔拭子检测样本时，WES检测技术可以获得更多更有效的基因信息
美通社 - 基因检测，贝瑞基因 - 2019-04-23
Nature子刊 | 多用途深度学习方法sciPENN，可预测、插补scRNA-seq、CITE-seq蛋白质表达
综上所述，研究团队开发了sciPENN深度学习模型，可以预测和估算蛋白质表达，集成多个CITE-seq数据集，量化预测和估算不确定性。
测序中国 - sciPENN，、插补scRNA-seq，CITE-seq蛋白质表达 - 2022-11-24
Nature子刊：多用途深度学习方法sciPENN，可预测、插补scRNA-seq、CITE-seq蛋白质表达
研究团队开发了sciPENN深度学习模型，可以预测和估算蛋白质表达，集成多个CITE-seq数据集，量化预测和估算不确定性。
测序中国 - 基因测序，深度学习 - 2022-11-24
Front Immunol：强直性脊柱炎患者外周血单个核细胞的整合单细胞RNA-SEQ和ATAC-SEQ分析
强直性脊柱炎(AS)是一种免疫介导的脊柱关节病。该研究集中在T细胞如何参与AS的发病机制，这将丰富AS单细胞研究的数据，为理解AS的发病机制提供新的视角。
MedSci原创 - 强直性脊柱炎，整合单细胞RNA-SEQ，ATAC-SEQ - 2022-02-19
SCI REP：利用 RNA-Seq 鉴别细菌和病毒感染
近日，国际杂志 《SCI REP》在线发表一项关于利用 RNA-Seq 鉴别细菌和病毒感染的研究。
MedSci原创 - 感染，细菌 - 2017-08-06
Science：开发出TT-Seq技术绘制人类瞬时转录组图谱
基因之间的序列长期以来被视为“垃圾DNA”，我们如今知道它们也发挥着至关重要的功能。这些DNA区域发生的突变能够严重地对人类发育造成损害，而且可能在生命后期导致严重疾病。然而，在此之前，调节性DNA序列一直很难发现。如今，在一项新的研究中，德国慕尼黑理工大学计算生物学教授Julien Gagneur团队和德国马克斯普朗克生物物理化学研究所教授Patrick Cramer团队如今开发出一种方法可
生物谷 - TT-Seq技术，人类瞬时转录 - 2016-06-04
Nucleic Acids Res:Tn-Seq数据统计方法新进展
近期，Nucleic Acids Res中一篇文章指出，Tn-Seq数据统计方法有了新进展。Tn-Seq是一种通过对复杂的随机转座子插入库的构造，来探索基因功能的实验方法；通过使用新一代的测序技术，对每一个突变的度进行量化。识别基因的相互作用是Tn-Seq的一项新兴应用，这包含了在不同遗传背景下进行Tn突变库的比较（例如野生型菌株与敲除型的比较）。为了识别基因间的相互作用，提出几种Tn-Seq数据
MedSci原创 - Tn-Seq，量化，基因 - 2017-03-25
利用Perturb-Seq和CRISP-Seq大规模平行分析数以万计基因扰动
单细胞筛选：一种向导RNA（gRNA）文库---每个gRNA靶向一个独特的基因用于CRISPR干扰，并且携带一种独特的条形码序列---被导入一个细胞群体中，这个细胞群体的密度确保一个gRNA平均进入一个细胞中。单个细胞随后被分选到携带添加着独特条形码的polyT引物的液滴中，这些引物被用来提取细胞的mRNA。随后，对这些mRNA进行测序揭示出引入的基因突变（所引入的突变是由gRNA决
生物谷 - 基因扰动，CRISPR，Cas9，Perturb-Seq，CRISP-Seq，向导RNA，mRNA，条形码 - 2017-03-28
CLIP-seq—动物miRNA靶基因筛选新方法
CLIP-seq，即紫外交联免疫沉淀结合高通量测序(crosslinking-immunprecipitation and high-throughput sequencing),是一项在全基因组水平揭示
MedSci原创 - CLIP-seq，miRNA - 2014-01-10
基于RNA-Seq的长非编码RNA（lncRNA）预测
当前lncRNA研究主要采用高通量RNA-Seq测序技术，并通过生物信息学方法对测序数据进行处理和分析，以挖掘其中lncRNA的序列、结构、表达及功
生物化学与生物物理学进展 - RNA-Seq，长非编码RNA - 2014-01-03
甲基化DNA免疫共沉淀测序原理及简介（MeDIP-seq）
MeDIP-Seq（Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing）测序是基于抗体富集原理进行测序的全基因组甲基化检测技术，采用甲基化DNA免疫共沉淀技术研究人员可以利用MeDIP-Seq
MedSci原创 - 甲基化，免疫共沉淀 - 2014-02-05
RNA-seq方法原理、数据分析、数据库及工具全面介绍
bsp;- De novo assembly of short reads with robust error correction. An improvement on early versions of SSAKE. * Velvet - Velvet is a de novo genomic assembler specially designed for sho
MedSci原创 - RNA-Seq，数据，数据库 - 2014-01-04
RNA-seq技术揭示与前列腺癌有关的新型融合基因
973首席科学家第二军医大学上海长海医院孙颖浩教授运用RNA-seq技术首次对中国人前列腺癌及癌旁组织进行系统研究，发现新型融合基因、癌相关长链非编码RNA、异构体和点突变。研究
MedSci原创 - 前列腺癌，融合基因 - 2012-03-21
Genome Res：新的多重Digenome-seq工具让CRISPR-Cas9飞得更高
自从2013年1月首次用于基因组编辑以来，CRISPR-Cas9的知名度与日俱增。让它如此引人注目的原因在于它惊人的高效性和实用性；简而言之，它比较容易使用。去年，来自韩国基础科学研究所基因组工程中心的Jin-Soo Kim研究团队在Cell Stem Cell期刊上发表一篇标题为“Functional Correction of Large Factor VIII Gene Chromoso
MedSci原创 - CRISPR，工具 - 2016-02-06
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