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Science：开发出TT-Seq技术绘制人类瞬时<font color="red">转录</font><font color="red">组</font><font color="red">图谱</font>

Science：开发出TT-Seq技术绘制人类瞬时转录组图谱

基因之间的序列长期以来被视为“垃圾DNA”，我们如今知道它们也发挥着至关重要的功能。这些DNA区域发生的突变能够严重地对人类发育造成损害，而且可能在生命后期导致严重疾病。然而，在此之前，调节性DNA序列一直很难发现。如今，在一项新的研究中，德国慕尼黑理工大学计算生物学教授Julien Gagneur团队和德国马克斯普朗克生物物理化学研究所教授Patrick Cramer团队如今开发出一种方法可

生物谷 - TT-Seq技术，人类瞬时转录 - 2016-06-04

Nature Methods：新算法利用空间<font color="red">转录</font><font color="red">组</font>数据构建肿瘤的“空间进化<font color="red">图谱</font>”

Nature Methods：新算法利用空间转录组数据构建肿瘤的“空间进化图谱”

癌症进展受多种因素驱动，研究推出 “CalicoST” 算法，可从空间转录组学数据推断相关 CNAs 并重建肿瘤进化轨迹，经验证优势明显，可为肿瘤研究提供助力。

测序中国 - 肿瘤，空间转录组学 - 2024-11-17

Cell Reports︱汤富酬研究<font color="red">组</font>与合作者绘制人类肾脏发育单细胞<font color="red">转录</font><font color="red">组</font><font color="red">图谱</font>

Cell Reports︱汤富酬研究组与合作者绘制人类肾脏发育单细胞转录组图谱

肾脏是人体最重要的内脏器官之一，对维持机体的酸碱平衡，调节水盐代谢，排泄代谢废物以及调节血压等方面都具有重要作用。过去几十年来基于小鼠模型的研究，已经相对完整地揭示了哺乳动物胚胎期肾脏的发育过程。然而由于小鼠和人类物种间差异的存在，长期以来对于人类胚胎期肾脏发育过程始终没有得到很好的说明，特别是关于肾脏发育过程中一些重要细胞类型的起源及其功能、以及参与完整肾单位发育成熟的分子调控机制等方面都亟待进

细胞 - 绘制，人类，肾脏，发育单细胞，转录组图谱 - 2018-09-28

Nat Commun：我国科学家首个小鼠全身各器官<font color="red">转录</font>因子蛋白质<font color="red">组</font><font color="red">图谱</font>

Nat Commun：我国科学家首个小鼠全身各器官转录因子蛋白质组图谱

复旦大学生命科学学院丁琛研究员课题组与国家蛋白质科学中心（北京）秦钧课题组合作发表了题为“A Mouse Tissue Transcription Factor Atlas”的研究论文，揭示了转录因子在小鼠各个不同器官的表达情况，为整个蛋白质组学研究填补了这一领域的空白。研究对于理解转录因子调控基因表达以及开展相应的基础和转化医学具有重要的理论指导和应用价值。

生物通 - 基因，转录因子，蛋白质，小鼠 - 2017-04-27

Nature Medicine：人类首次描绘月经周期中子宫内膜单细胞<font color="red">转录</font><font color="red">组</font><font color="red">图谱</font>

Nature Medicine：人类首次描绘月经周期中子宫内膜单细胞转录组图谱

人类的月经周期，就是每月一次的子宫内膜（endometrium）的脱落、再生和重塑的过程。该研究使用单细胞测序技术，系统地表征了月经周期这一人类独特的生理过程。

Bio生物世界 - 子宫内膜，月经周期，转录组图谱 - 2020-09-16

Nat Commun：基于单细胞和空间<font color="red">转录</font><font color="red">组</font>学分析构建NSCLC免疫和非免疫区<font color="red">图谱</font>

Nat Commun：基于单细胞和空间转录组学分析构建NSCLC免疫和非免疫区图谱

研究团队将来自25名未接受治疗LUAD或LUSC患者的近90万个细胞的scRNAseq数据和其中8名患者的空间转录组学数据结合起来，系统研究了肿瘤和邻近非肿瘤组织中细胞组织的差异。

测序中国 - NSCLC，肺癌，空间转录组学 - 2024-06-18

PNAS发表全面的小鼠耳蜗单细胞<font color="red">转录</font><font color="red">组</font><font color="red">图谱</font>，为遗传性耳聋靶向治疗提供参考

PNAS发表全面的小鼠耳蜗单细胞转录组图谱，为遗传性耳聋靶向治疗提供参考

通过将单细胞、单核RNA测序（scRNAseq和snRNAseq）与广泛的RNA原位杂交检测（RNA scope）相结合，表征了几乎所有耳蜗细胞类型的转录组学特征。

测序中国 - 遗传性耳聋 - 2023-07-11

Blood：血小板和iPSC来源的巨核细胞的全基因<font color="red">组</font><font color="red">转录</font><font color="red">图谱</font>和RNA测序

Blood：血小板和iPSC来源的巨核细胞的全基因组转录图谱和RNA测序

GWAS研究已经明确了与血小板相关表型相关的常见变异，但由于这些变异主要位于内含子中或基因间，它们与血小板生物学特征的相关性尚不清楚。

MedSci原创 - 血小板，巨核细胞，数量性状位点(eQTL) - 2020-11-02

Cell：衰老小鼠大脑时空<font color="red">转录</font><font color="red">组</font><font color="red">图谱</font>并报道胶质细胞衰老区域特异性

Cell：衰老小鼠大脑时空转录组图谱并报道胶质细胞衰老区域特异性

神经胶质细胞衰老的全脑基因特征，证实其存在空间异质性。与皮层相比，白质神经胶质衰老加速，特异性神经元群体具有区域特异性

brainnew神内神外 - 衰老，细胞衰老，胶质细胞，转录组图谱 - 2023-09-11

Nat Commun：空间<font color="red">转录</font><font color="red">组</font>学和单细胞多组学整合分析构建人类胸腺细胞发育空间<font color="red">图谱</font>

Nat Commun：空间转录组学和单细胞多组学整合分析构建人类胸腺细胞发育空间图谱

研究团队开发了TSO-his（组织结构的转录组学分割）工具，用于整合单细胞和空间转录组学的多模态数据，并破译人类胸腺的复杂结构。

测序中国 - 胸腺，空间转录组学，空间图谱 - 2024-10-14

Nature | 单细胞分辨率绘制食蟹猴胚胎综合<font color="red">转录</font><font color="red">组</font><font color="red">图谱</font>，揭示原肠胚形成和早期器官发生

Nature | 单细胞分辨率绘制食蟹猴胚胎综合转录组图谱，揭示原肠胚形成和早期器官发生

该研究揭示了主要的泌乳周细胞类型的转录组特征，有助于阐明灵长类动物的形态发生事件。

测序中国 - 转录组图谱，单细胞分辨率，胚胎综合 - 2023-01-05

Cell Research :汤富酬/乔杰/王晓群合作<font color="red">组</font>首次绘制人类胚胎大脑全皮层<font color="red">转录</font><font color="red">组</font><font color="red">图谱</font>并揭示区域发育异质性

Cell Research :汤富酬/乔杰/王晓群合作组首次绘制人类胚胎大脑全皮层转录组图谱并揭示区域发育异质性

https://www.nature.com/articles/s41422-018-0053-3

BioArt - 汤富酬/乔杰/王晓群合作组首次绘制人类胚胎大脑全皮层转录组图谱并揭示区域发育异质性 - 2018-06-06

Nat Commun：中国科学院王跃祥等团队合作研究阐明了人胃肠道间质瘤的基因<font color="red">组</font>和<font color="red">转录</font><font color="red">组</font><font color="red">图谱</font>

Nat Commun：中国科学院王跃祥等团队合作研究阐明了人胃肠道间质瘤的基因组和转录组图谱

该研究全面分析阐述来自105名患者的117例GIST队列的基因组和转录组情况，其中包括31例低风险、18例中风险、29例高风险、34例转移性和5例新辅助GIST。

iNature - 胃肠道间质瘤，转录组图谱 - 2024-11-08

Nature：癌症基因<font color="red">组</font><font color="red">图谱</font>计划完成

Nature：癌症基因组图谱计划完成

在美国大型癌症基因组计划告一段落后，卵巢癌是还将进行集中测序的若干肿瘤类型之一 美国一项从遗传学角度描述1万个肿瘤的庞大计划日前正式落下帷幕。作为在2006年开始的一个斥资1亿美元的试点项目，癌症基因组图谱（TCGA）如今是国际癌症基因组联盟中最大的组成部分，该联盟由来自16个国家的科学家组成，已经发现了近1000万个与癌症相关的基因突变。

《中国科学报》 - 癌症，基因组，图谱 - 2015-01-07

单细胞转录组研究进展

   单细胞转录组分析以单个细胞为特定研究对象，提取mRNA进行逆转录、放大和高通量测序分析，能揭示该细 胞内整体水平的基因表达状态和基因结构信息，准确反映细胞间的异质性，深入理解其基因型和表型之间的相互关系，在发育生物学、基础医学、临床诊断和药物开 发等领域都发挥重要作用．本文主要介绍了单细胞转录组分析的特点和技术发展历史以及常用研究策略和不同技术的优缺点，并就其面临挑战

生物化学与生物物理学进展 - 转录组，单细胞转录组 - 2014-01-03

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