Nature Genetics:王艇团队从转座子中发现泛癌症新抗原
该研究通过开发新的算法,从大数据中深入剖析了TE基因嵌合转录本在33种不同癌症类型的表达,强调了它们作为癌症靶点的可能性,并为免疫疗法及肿瘤疫苗开发提供了大量可针对的潜在靶标。
“生物世界”公众号 - 转座子,泛癌新抗原 - 2023-03-28
Nature Genet:转座子突变分析发现黑色素瘤驱动基因
近日,国际学术期刊nature genetics在线发表了美国科学家的一项最新研究进展,他们发现sleeping beauty(SB)转座子造成的突变能够促进BRAFv600e突变小鼠黑色素瘤的发生
生物谷 - 转座子,黑色素瘤,基因 - 2015-04-29
PNAS:转座子影响衰老又出新成果,节食或可延长寿命
转座子是基因组中一段可移动的DNA序列,它可以通过切割、重新整合等一系列过程从基因组的一个位置“跳跃”到另一个位置,在异染色质中含量丰富。近日,来自布朗大学的研究提出衰老过程的转座子理论。科学家认为,转座子是一个“无赖”的DNA元件,以至于它可以打破衰老细胞防守,在基因组其他地方插入自身DNA,造成细胞功能紊乱,影响寿命。这项研究发表在近日的PNAS杂志上。
生物探索 - 衰老,转座子 - 2016-09-15
Science:逆转录转座子在肿瘤发生中的重要作用
6月28日,Science杂志在线报道了关于体细胞逆转录转座子在人类肿瘤发生中作用的最新研究进展。 转座子(TEs)在人类基因组中含量丰富,有些能够通过RNA中间体产生新的插入序列。在癌症细胞中,通常抑制TE活动的机制如果遭到破坏,可能会促进诱导突变的逆转录转座子的产生。研究者对五个类型的癌症中 43个高覆盖率全基因组测序数据集的TE插入序列,进行了单个核苷酸分辨率的分析。
本站原创 - Science,肿瘤,癌症 - 2012-07-02
Nat Commun:王建新/胡斌教授团队建立基于动态边界调整算法的转座子元件检测和注释方法
基于基因组组装数据,提出了快速准确的转座子识别和注释算法,并开发了相应的软件HiTE。
测序中国 - 转座子,基因组组装,HiTE - 2024-07-07
Cell Rep:中科院上海生科院韩敬东研究组揭示非编码RNA和转座子在长寿中的作用机制
近日,国际著名学术杂志《Cell》子刊《Cell Reports》杂志在线发表了中国科学院马普学会计算生物学伙伴研究所韩敬东研究员题为Impact of Dietary Interventions on Noncoding RNA Networks and mRNAs Encoding Chromatin-Related Factors 的研究论文。
生物帮 - 非编码RNA,转座子,长寿 - 2017-04-06
CRISPR相关转座酶,在人类细胞中实现无双链断裂的DNA定向整合
该研究报告了一种通过使用I-F型CRISPR相关转座酶(CAST)来避免产生DNA双链断裂(DSB)并在人类细胞中实现大片段DNA定向整合的可编程集成方法,为利用CRISPR相关转座酶进行人类基因组工
生物世界 - CRISPR相关转座酶 - 2023-04-08
Science:新机制有助于开发基因疗法
为了理解转座子如何塑造基因组,揭示其靶向作用的分子机制非常关键,近日刊登在国际杂志Science上的一项研究报告中,来自巴黎第七大学(Universite Paris Diderot)等处的科学家通过研究鉴别出了两种特殊蛋白的相互作用对于转座子整合入酵母基因组的特殊区域非常关键,该研究强调了转座子作为移动的DNA元件在进化中的重要性以及对于开发基因疗法的关键作用。转座子是一种可以在基因组中
生物谷 - 基因,靶向治疗,DNA序列 - 2015-05-07
Cell:改写认知,首次证实:“垃圾DNA”是胚胎发育的关键
在人的生命中,有一个阶段是一个双细胞的胚胎(two-celled embryo)。近日,发表在Cell杂志上的一项突破成果表明,胚胎发育能够通过这一阶段与先前被科学家们视为“垃圾”的一种DNA密切相关!
生物探索 - Cell,首次,垃圾DNA,胚胎发育 - 2018-07-01
Cell:我国科学家将适应性免疫的起源向前推进1亿年
在国家自然科学基金委和科技部高技术发展计划(863)和国家重大基础研究发展计划(973)的资助下,中山大学徐安龙教授领导的研究团队发现了6亿年前重组激活基因转座子的“分子活化石”,为“人类抗体重排机制的转座子起源假说
新华社 - 免疫,中山大学 - 2016-07-29
PNAS:肝癌早诊率提高100%!基因筛查再发力!
研究人员在肝脏特异性Pten基因敲除小鼠模型(PtenKO)和高脂饮食小鼠模型中进行了“睡眠美容”转座子突变筛选。(Pten基因编码由403个氨基酸组成的蛋白质,具有磷酸酯酶的活性。
转化 - 肝癌,早诊,基因筛查 - 2018-10-24
Cell Host & Microbe:转座子突变测序法霍乱弧菌肠道定殖揭示T6SS介导的宿主杀菌效应
2013年10月,著名的'细胞'杂志社(Cell Press)接收了来自南开大学生命科学院博士、哈佛大学医学院博士后研究员傅暘博士的最新科研成果--"转座子突变测序法霍乱弧菌肠道定殖必需基因研究以及由此揭示的宿主体内细菌第六型蛋白分泌系统介导的杀细菌作用的激活
生物谷 - 霍乱,突变,测序 - 2014-01-28
NAT GENET: 睡美人发现新的癌基因
“睡美人”转座子是第一瘤研究中起到了重要作用。通过癌症基因组测序确定的绝大多数遗传改变需要进一步的研究方法来解释其意义和相互作用。
MedSci原创 - 睡美人:癌症,基因 - 2017-03-21
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