Nature Methods：突破传统方法：DeepPBS模型助力蛋白质-DNA相互作用研究
该研究展示了DeepPBS如何与结构预测方法结合使用，以预测没有实验结构的蛋白质的特异性。通过优化结合DNA的DeepPBS反馈，可以改进蛋白质-DNA 复合物的设计。
生物探索 - DeepPBS模型，蛋白质-DNA - 2024-08-08
FDA 行业指南：治疗性蛋白质药物相互作用评估
本指南的目的是帮助研究性新药 (IND) 申请的发起人和生物许可申请 (BLA) 的申请人通过提供系统的、风险的建议来确定对治疗性蛋白质进行药物-药物相互作用 (DDI) 研究的必要性基于的方法。
FDA官网 - 治疗性蛋白质药物 - 2023-06-05
Nature Genetics：基因调控的精准地图：ChIP-DIP技术开启蛋白质-DNA相互作用的新纪元
本文介绍 ChIP-DIP 技术，阐述其因能同时捕捉多蛋白质 - DNA 相互作用以突破传统技术局限而诞生，详述其工作原理、创新突破、数据验证、扩展应用及在免疫反应中的应用，展望其发展前景。
生物探索 - ChIP-DIP技术，蛋白质-DNA相互作用 - 2024-11-28
Tau和PQBP1：蛋白质相互作用诱导大脑中的炎症
东京医科齿科大学的研究人员阐明了细胞受体 PQBP1 在神经退行性疾病蛋白 Tau 诱导的脑部炎症中的作用。
网络 - 脑部炎症 - 2021-12-20
Nature Methods：解码RNA与蛋白质相互作用的新视角：TREX技术的突破
TREX技术，作为一种创新的实验方法，为研究活细胞中特定RNA区域与RNA结合蛋白之间的互作提供了强有力的工具。
生物探索 - RNA分子，TREX技术 - 2024-02-27
Nature：AlphaFold 3解开蛋白质与所有分子相互作用奥秘，或可引发药物研发革命
从此，人类冲破「蛋白质宇宙」，所有生物分子结构都可以预测了！这次使用的，还是AI革命最核心的组合架构——Transformer+Diffusio
MedSci原创 - 药物研发，DeepMind，AlphaFold，AlphaFold 3 - 2024-05-12
Hypertension：Nox细胞亚定位、蛋白质过氧化和ER应激反应的相互作用在高血压中的作用
但是，这些过程的相互关系尚不明确。Livia L. Camargo等人推测Nox亚型的特殊细胞亚定位，促进氧化和ER应激，进而影响高血压的氧化蛋白质组和血管功能。
MedSci原创 - ER应激，高血压，血管Nox，活性氧 - 2018-06-04
Nature：不止蛋白质结构！AlphaFold3可高精确度预测生物分子结构及相互作用
推出了全新的预测工具AlphaFold3（AF3），这是一个能够高精度预测蛋白质数据库（PDB）内几乎所有分子类型复合物的模型，包括准确预测蛋白质、DNA、RNA、小分子配体结构以及其相互作用模式。
测序中国 - AlphaFold3，生物分子结构 - 2024-05-25
甲醛不只损伤DNA，还有蛋白质
该研究的通讯作者、布朗大学的Anatoly Zhitkovich教授说：“甲醛不仅会破坏DNA，还会对蛋白质形成损伤。一方面，破坏细胞核中的蛋白质能够削弱DNA损
生物探索 - 甲醛，DNA - 2016-10-03
Nature：中外团队合作，首次通过AI从头设计蛋白-蛋白间相互作用，直接生成抗体药物
该研究开发了一种利用蛋白质表面特征指纹图谱的机器学习方法，来从头设计新的蛋白质，这些蛋白质与癌症免疫治疗靶标或新冠病毒靶标的结合亲和力与自然产生的抗体相当。
生物世界 - 抗体药物，AI - 2023-05-04
Blood：血小板通过Clec-2与平足蛋白相互作用调节肺发育
中心点：血小板Clec-2与淋巴平足蛋白通过促进肥胖成纤维细胞分化协同调节肺发育。肺泡管成纤维细胞分化在一定程度上受血小板被Clec-2/平足蛋白相互作用激活释放TGF-β调节。但是，血小板在固体器官发育中是否发挥作用尚不明确。近日，Blood杂志上发表一篇文章，研究人员发现血小板可通过血小板激活受体（C型凝集素样
MedSci原创 - 血小板，肺发育，CLEC-2，平足蛋白 - 2018-06-02
清华研究出蛋白质镜像DNA拷贝，或能有效对抗病毒
清华大学研究人员创造出与生命功能密切相关的蛋白质镜像，拷贝DNA并将其转化成RNA，这是制造能更有效地对抗病毒入侵的反向版本分子的关键步骤。虽然一些“手性”分子自然存在于正常和反向形式中，但基本大部分的生命都证明DNA细胞向右扭曲，病毒和酶已在这些模板里发展到目标生命，因此目前最盛行的理论是人造镜像版DNA在自身机能正常运行时还能阻止病毒入侵近些年来，科学家一直在制造镜像DNA，因此
生物谷 Bioon.com - DNA，蛋白质镜像 - 2016-05-21
染色质免疫沉淀-测序(ChIP-seq)：全基因组范围研究蛋白质-DNA相互作用的新技术
染色质免疫沉淀-测序(ChIP-seq)是近年来新兴的将染色质免疫沉淀(ChIP)与深度测序技术相结 合，在全基因组范围内分析DNA结合蛋白结合位点、组蛋白修饰、核小体定位和DNA甲基化的高通量技术
生物化学与生物物理学进展 - ChIP，seq，染色质免疫沉淀，基因组 - 2014-01-03
研究绘制自闭症蛋白相互作用图
一项新的研究显示，自闭症患者脑中的分子通路与脆性X综合症、安格曼综合症及瑞特综合征等相关疾病密切相关而且共有某些关键性的蛋白质。这些发现也许能够作为发现更多的自闭症基因的一个平台。
2011-06-15
JCI：自噬作用可保护胰腺β细胞免于毒性蛋白质的损伤
II型糖尿病个体中往往存在一种过量的名为胰岛淀粉样多肽的蛋白质（IAPP），该蛋白质的积累往往和产生胰岛素的胰腺β细胞的缺失直接相关，引发糖尿病患者机体中IAPP的积累的原因至今仍是个谜；近日，来自加州大学洛杉矶分校的研究人员通过研究揭开了谜底，研究者发现了一种自体吞噬现象，即从细胞中清除损伤或者有毒的蛋白质，相关研究刊登于国际杂志Journal of Clinical Investigation
生物谷 - 胰腺β细胞，自噬作用，毒性蛋白质 - 2014-07-30
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