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Science：<font color="red">空间</font><font color="red">组</font><font color="red">学</font><font color="red">技术</font>概览与展望

Science：空间组学技术概览与展望

该综述系统地介绍了空间组学技术的丰富种类，阐明了其原理、优势和局限性，并就这一领域目前面临的挑战提供了观点和建议。

测序中国 - 空间组学 - 2023-08-26

Science：利用<font color="red">空间</font>转录<font color="red">组</font><font color="red">学</font><font color="red">技术</font>可视化观察组织中的基因表达

Science：利用空间转录组学技术可视化观察组织中的基因表达

在一项新的研究中，来自瑞典卡罗琳斯卡研究所和皇家理工学院等机构的研究人员开发出一种新的被称作空间转录组学（spatial transcriptomics）的高分辨率方法研究一种组织中哪些基因是有活性的

生物谷 Bioon.co - 转化医学，转录，RNA - 2016-07-04

Nat Biotechnol发表新<font color="red">空间</font><font color="red">组</font><font color="red">学</font>方法，同步实现转录<font color="red">组</font>和代谢<font color="red">组</font>的<font color="red">空间</font>多模态精确分析

Nat Biotechnol发表新空间组学方法，同步实现转录组和代谢组的空间多模态精确分析

研究团队证明了在单个组织切片中结合SRT和MALDI-MSI并保留两种模式的特异性和敏感性的可能性，并在多巴胺和帕金森病条件下的小鼠和人类大脑样本中证明了该方法的潜力。

测序中国 - 空间多模态精确分析 - 2023-10-03

Nat Commun：<font color="red">空间</font>转录<font color="red">组</font><font color="red">学</font>和单细胞多组<font color="red">学</font>整合分析构建人类胸腺细胞发育<font color="red">空间</font>图谱

Nat Commun：空间转录组学和单细胞多组学整合分析构建人类胸腺细胞发育空间图谱

研究团队开发了TSO-his（组织结构的转录组学分割）工具，用于整合单细胞和空间转录组学的多模态数据，并破译人类胸腺的复杂结构。

测序中国 - 胸腺，空间转录组学，空间图谱 - 2024-10-14

Nucleic Acids Res：<font color="red">空间</font>转录<font color="red">组</font><font color="red">学</font>数据挖掘新算法——DeepST

Nucleic Acids Res：空间转录组学数据挖掘新算法——DeepST

研究团队研发了基于深度学习的空间域识别技术（DeepST）。DeepST使用预先训练好的深度神经网络模型从组织形态学信息（H&E染色图片）中提取图像特征，然后将提取的特征与基因表达和空间位置数据集成，

测序中国 - 数据挖掘，算法，空间转录组学 - 2022-10-24

Nature Genetics：BANKSY：革命性算法，重塑<font color="red">空间</font><font color="red">组</font><font color="red">学</font>数据分析

Nature Genetics：BANKSY：革命性算法，重塑空间组学数据分析

该算法作为一种创新的空间组学数据分析工具，其主要功能是将空间组学数据中的细胞根据类型和组织域进行有效分类。

生物探索 - 空间组学，BANKSY - 2024-03-04

Genome Biol综述 | 多模态和单细胞/亚细胞水平<font color="red">空间</font><font color="red">组</font><font color="red">学</font><font color="red">技术</font>的现状及发展前景

Genome Biol综述 | 多模态和单细胞/亚细胞水平空间组学技术的现状及发展前景

空间组学领域在过去几年蓬勃发展，并从根本上提高了原位实验的广度和分辨率。这些技术现在可以在50-100nm的空间分辨率下检测超过10,000个独特的基因靶点。

测序中国 - 多模态和单细胞，亚细胞水平空间组学技术，空间组学实验 - 2022-12-29

<font color="red">空间</font>转录<font color="red">组</font><font color="red">学</font>方法EEL FISH：可实现高复用、高<font color="red">空间</font>通量和高分辨的原位单细胞分析

空间转录组学方法EEL FISH：可实现高复用、高空间通量和高分辨的原位单细胞分析

大脑是一个高度结构化的器官，包含多种细胞类型，具有复杂的空间模式组织。目前研究分析这些不同细胞类型之间的组织和空间关系仍具有挑战性。

测序中国 - 空间转录组学方法，高空间通量，高分辨的原位单细胞分析 - 2022-11-13

Nat Methods：基于测序的11种<font color="red">空间</font>转录<font color="red">组</font><font color="red">学</font>方法的系统比较

Nat Methods：基于测序的11种空间转录组学方法的系统比较

研究团队选择了一系列具有明确定义的组织结构特征的组织作为参考，使用其生成数据比较了11种sST方法。

测序中国 - 单细胞转录组测序，空间转录组技术 - 2024-08-03

Nature Genetics：高通量<font color="red">空间</font>转录<font color="red">组</font><font color="red">技术</font>推动器官发生研究：MAGIC-seq为临床多组<font color="red">学</font>研究提供新工具

Nature Genetics：高通量空间转录组技术推动器官发生研究：MAGIC-seq为临床多组学研究提供新工具

介绍创新的空间转录组技术 MAGIC-seq，其结合多种技术提升标记效率，在多方面表现优势，可构建 3D 图谱，应用前景广泛。

生物探索 - 空间转录组学，MAGIC-seq，微流体技术 - 2024-09-12

eGastroenterology：基于<font color="red">空间</font>转录<font color="red">组</font><font color="red">学</font>揭示HBV及其与HDV和HIV共感染的生物<font color="red">学</font>特征

eGastroenterology：基于空间转录组学揭示HBV及其与HDV和HIV共感染的生物学特征

该研究首次利用空间转录组技术解析HBV及其与HDV和HIV共感染的生物学特征。

eGastroenterology - HIV，HBV，HDV，生物学特征 - 2024-08-06

Nat Rev Clin Oncol综述：深入解析癌症的<font color="red">空间</font><font color="red">组</font><font color="red">学</font>景观——机遇与挑战并存

Nat Rev Clin Oncol综述：深入解析癌症的空间组学景观——机遇与挑战并存

在这篇综述中，研究团队总结了以空间转录组学为重点的空间分析技术的现状，概述了空间分析技术在癌症研究应用中的主要发现，并讨论了将这些发现整合到临床实践中的机遇和挑战。

测序中国 - 癌症研究，肿瘤微环境，空间转录组学，空间生物学 - 2024-08-21

Nature：<font color="red">空间</font>转录<font color="red">组</font><font color="red">学</font>开辟记忆编码新视角：长期恐惧记忆的分子地图

Nature：空间转录组学开辟记忆编码新视角：长期恐惧记忆的分子地图

研究员通过高分辨率的空间和单细胞转录组学分析，研究者能够在分子和细胞层面上阐明BLA在长期记忆中的作用。

生物探索 - 长期记忆，BLA，空间转录组学 - 2024-02-13

黄芪-红花如何神奇逆转脑缺血/再灌注损伤：<font color="red">空间</font>代谢<font color="red">组</font><font color="red">学</font>的惊人发现！

黄芪-红花如何神奇逆转脑缺血/再灌注损伤：空间代谢组学的惊人发现！

文章揭示了CIRI在系统和微区水平的特定代谢重编程并阐明了AC的治疗机制。

MedSci原创 - 黄芪，脑缺血/再灌注损伤 - 2024-08-20

基因组学技术进展(Genome Technology)

第一主题           基因组学技术进展 1.  测序新技术 2.  转录基因组学 3.  表观基因组学 4.  外显子组学   1.Genome Technology ?

会议 - 2009-03-11

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