Nat Biotechnol发表新空间组学方法,同步实现转录组和代谢组的空间多模态精确分析
研究团队证明了在单个组织切片中结合SRT和MALDI-MSI并保留两种模式的特异性和敏感性的可能性,并在多巴胺和帕金森病条件下的小鼠和人类大脑样本中证明了该方法的潜力。
测序中国 - 空间多模态精确分析 - 2023-10-03
Science:空间组学技术概览与展望
该综述系统地介绍了空间组学技术的丰富种类,阐明了其原理、优势和局限性,并就这一领域目前面临的挑战提供了观点和建议。
测序中国 - 空间组学 - 2023-08-26
黄芪-红花如何神奇逆转脑缺血/再灌注损伤:空间代谢组学的惊人发现!
文章揭示了CIRI在系统和微区水平的特定代谢重编程并阐明了AC的治疗机制。
MedSci原创 - 黄芪,脑缺血/再灌注损伤 - 2024-08-20
Nat Commun:单细胞空间代谢组学分析框架scSpaMet,可对同一组织进行空间分辨蛋白质和代谢物分析
文章提出了单细胞空间分辨代谢框架“scSpaMet”,通过将非靶向空间代谢组学和靶向多重蛋白质成像整合到单一管道中,在单细胞水平上分析人体组织中的免疫细胞和癌症细胞。
测序中国 - 单细胞,空间代谢组学,scSpaMet - 2024-02-03
Nat Commun:空间转录组学和单细胞多组学整合分析构建人类胸腺细胞发育空间图谱
研究团队开发了TSO-his(组织结构的转录组学分割)工具,用于整合单细胞和空间转录组学的多模态数据,并破译人类胸腺的复杂结构。
测序中国 - 胸腺,空间转录组学,空间图谱 - 2024-10-14
Nucleic Acids Res:空间转录组学数据挖掘新算法——DeepST
研究团队研发了基于深度学习的空间域识别技术(DeepST)。DeepST使用预先训练好的深度神经网络模型从组织形态学信息(H&E染色图片)中提取图像特征,然后将提取的特征与基因表达和空间位置数据集成,
测序中国 - 数据挖掘,算法,空间转录组学 - 2022-10-24
AJOG:宫颈阴道代谢组学预测早产
早产的发病机理研究中,越来越多的研究着眼于孕妇宫颈阴道的代谢组学变化,这是一个新奇的研究领域。Ghartey J等人进行了一项
MedSci原创 - 宫颈阴道,代谢组学,早产 - 2015-04-07
Nature Genetics:BANKSY:革命性算法,重塑空间组学数据分析
该算法作为一种创新的空间组学数据分析工具,其主要功能是将空间组学数据中的细胞根据类型和组织域进行有效分类。
生物探索 - 空间组学,BANKSY - 2024-03-04
空间转录组学方法EEL FISH:可实现高复用、高空间通量和高分辨的原位单细胞分析
大脑是一个高度结构化的器官,包含多种细胞类型,具有复杂的空间模式组织。目前研究分析这些不同细胞类型之间的组织和空间关系仍具有挑战性。
测序中国 - 空间转录组学方法,高空间通量,高分辨的原位单细胞分析 - 2022-11-13
Diabetologia:糖尿病患者的代谢组学
近日,国际杂志 《Diabetologia》上在线发表一项关于糖尿病患者的代谢组学的研究。 代谢组学分析可以提供揭示与糖尿病病理生理学相关的代谢途径并改善糖尿病风险预测的潜力。研究人员前瞻性地分析了从基线(1987-1989)和事件性糖尿病到2015年12月31日的2939例动脉粥样硬化风险社区(ARIC)研究参与者和无糖尿病患者的代谢组学数据,使用非靶向方法测定他们血清标本中的已知代谢物
MedSci原创 - 糖尿病,患者,代谢组 - 2018-05-31
Nat Methods:基于测序的11种空间转录组学方法的系统比较
研究团队选择了一系列具有明确定义的组织结构特征的组织作为参考,使用其生成数据比较了11种sST方法。
测序中国 - 单细胞转录组测序,空间转录组技术 - 2024-08-03
J Ethnopharmacol:代谢组学结合转录组学揭示瓜蒌薤白汤抗慢性心肌缺血机制
该研究通过代谢组学结合转录组学揭示瓜蒌薤白汤抗慢性心肌缺血机制。
MedSci原创 - 中医药,代谢组学,转录组学,慢性心肌缺血,瓜蒌薤白汤 - 2022-09-21
J Ethnopharmacol:结合非靶向代谢组学和靶向代谢组学研究知母-黄柏药对治疗前列腺增生的作用机制
从代谢角度阐明中药药对知母-黄柏对良性前列腺增生症(BPH)的潜在治疗机制。
MedSci原创 - 代谢组学,知母,良性前列腺增生,中药药对,黄柏 - 2024-07-14
JNNP:非靶向代谢组学研究ALS的发病机制
肌萎缩性侧索硬化症(ALS)是一种进行性的、致命的运动神经元变性疾病,其特点是复杂的基因和疾病机制,以及环境的影响。 虽然少数基因与肌萎缩侧索硬化症(ALS)密切相关,但在大多数散发病例中,遗传原因尚
MedSci原创 - ALS,发病机制,非靶向代谢组学 - 2020-09-25
Cancer Res:肝癌代谢组学研究获进展
日前,中科院大连化学物理研究所研究员许国旺团队与上海东方肝胆医院王红阳院士课题组合作,将基于液相色谱—质谱用于肝癌组织非靶标代谢组学研究并取得了重要进展,相关成果在美国《癌症研究》上在线发表。组织代谢组学方法是研究肝癌代谢异常的有力工具,可为肝癌发
中国科学报 - 肿瘤,肝癌代谢,王红阳 - 2013-11-11
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