Nature:中国学者领衔,人类“泛基因组”成果登上封面!
由国际人类泛基因组参考联盟牵头,由美国国立卫生研究院国家人类基因组研究所 (NHGRI) 资助的研究人员发布了一份人类“泛基因组”草稿——这是一个新的、可用的基因组学参考,它结合了来自不同祖先背景的
BioMed科技 - 泛基因组 - 2023-05-14
Nature:36个中国人口的泛基因组参考
中国大基因组联盟的数据表明,当个人来自代表性不足的少数民族群体时,发现新颖和缺失序列的显著增加。
MedSci原创 - 全基因组相关性研究,中国人 - 2023-07-18
Nat Commun:上海交大发布中国人胃癌泛基因组学分析
该研究首次将全新的泛基因组研究方法用于人类肿瘤基因组研究。通过构建胃癌人群泛基因组,再以泛基因组作为参照将每一例全基因组测序数据予以比对。
“生物世界”公众号 - 胃癌,泛基因组学 - 2022-09-27
Nature:首个人类泛基因组草图公布,更完整的描绘了遗传多样性
这一次泛基因组参考序列包含了来自47个人的数据,其中也有来自中国人的代表。未来更是计划在2024年扩展到350个人。
MedSci原创 - 遗传多样性,泛基因组 - 2023-05-12
CLIN CHEM:羊水胎儿基因组的全基因组测序和分析
羊膜穿刺术是一种常见的手术,其主要目的是从胎儿收集细胞对异常染色体、染色体拷贝数的改变、少量单基因至多基因缺陷进行测试,。在这里,研究人员展示了从羊水样品的细胞或游离DNA(cfDNA)对胎儿进行精确全基因组分析的可行性。使用Complete Genomics nanoarray平台,对从31个羊膜组织中分离出的cfDNA和DNA进行测序,基因组覆盖率为50×。在一部分样品中,从分离自细胞
MedSci原创 - 羊水,胎儿,基因组 - 2018-04-04
Nat Methods:新泛基因组研究工具包PGR-TK,可在多种尺度上分析重复/临床相关复杂基因变异
通过将PGR-TK中的图分解方法应用于二型主要组织相容性复合体(MHC-II)中,证明了人类泛基因组对分析复杂基因区域的重要性。
测序中国 - 泛基因组,PGR-TK - 2023-07-12
Cancer Cell:基于上千例泛癌多组学数据,CPTAC发布蛋白基因组学共享数据资源
该文章概述了CPTAC泛癌研究团队在数据协调、数据传播和帮助生物发现的计算资源方面所做出的努力,并讨论了多组学数据整合和分析的挑战。
测序中国 - 泛癌多组学,蛋白基因组学 - 2023-08-30
Cell:综合泛癌蛋白基因组学分析揭示跨越10种癌症类型的7种免疫亚型
该研究使用临床蛋白质组肿瘤分析联合会(CPTAC)的泛癌蛋白质基因组数据集全面表征了来自10种癌症的1056个肿瘤样本的免疫图谱。
测序中国 - 泛癌蛋白质基因组,免疫亚型,癌症 - 2024-03-22
Cell:章冰/高强团队合作泛癌蛋白基因组学研究,揭示癌症治疗潜在新靶点
研究团队将CPTAC的10种癌症类型1043名患者的蛋白基因组学数据集与其他公共数据集,阐明了癌症治疗的蛋白质新靶点。
测序中国 - 癌症,药物靶点 - 2024-07-20
蛋白质基因组学:运用蛋白质组技术注释基因组
随着高通量DNA测序技术的飞速发展,越来越多的物种完成了基因组测序.定位编码基因、确定编码基因结构是 基因组注释的基本任务,然而以往的基因组注释方法主要依赖于DNA及RNA序列信息.为了更加精确地解读完成测序的基因组,我们需要整合多种类型的组学数 据进行基因组注释.近年来,基于串联质谱技术的蛋白质组学已经发展成熟,实现了对蛋白质组的高覆盖,使得利用串联质谱数据进行基因组注释成为可
生物化学与生物物理学进展 - 亚硝基化谷胱甘肽还原酶,GSNOR,NO,炎症因子 - 2014-01-03
Nat Commun:飞蝗全基因组序列被破译 暂为最大动物基因组
来自中国科学院动物研究所康乐院士领衔的团队、深圳华大基因研究院等单位的科研人员成功破译了迄今为止最大的动物基因组——飞蝗全基因组序列图谱,为揭示蝗灾暴发机制,开发可持续性治理策略及新的控制方法提供了宝贵的遗传资源
MedSci原创 - 基因组,飞蝗 - 2014-01-19
Cell:癌症基因组沉思录
癌症基因组沉思录近日,哈佛麻省Broad研究院的著名遗传学家Eric S.Lander教授与另外一位学者完成了题为“Lessons from the Cancer Genome”的文章,介绍了癌症基因组的系统性研究进展,概况了在细胞信号传导,染色体和表观遗传调控等方面发现的新癌基因Lander 教授是Broad医学院的创始人之一,人类基因组计划领导者之一
生物360 - Cell,癌症,基因组 - 2013-05-10
把基因组上传到云端
近日,Google正式推出了Google Genomics,这一产品可以让科学家把基因组数据存储在云端,并对DNA序列进行研究和共享。
果壳网 - 基因治疗 - 2014-11-11
Science:基因组怎么“藏猫猫”
随着基因测序成本直线下降,专家认为,我们的基因组将有助于医生发现疾病,拯救生命。但并不是每个人都愿意将自己的基因组序列公之于众。所谓的同态加密方法,可以帮助保持基因组隐私,就好像基因检测转移到廉价的在线云服务一样。 现有的加密技术常以数据无法使用为代价而保证数据安全的。正因为此,大多数基因序列在发送出去进行分析前
测序中国 - 基因 - 2014-03-14
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