NATURE：染色质碎裂助力肿瘤耐药
通过额外的几轮染色体碎裂，ecDNA的结构进化进一步提高了药物耐受性。原位Hi-C测序显示，ecDNAs优先存在于染色体末端附近，当DNA损伤时，它们会在那里重新整合。
MedSci原创 - 染色质重塑，肿瘤耐药性 - 2020-12-26
Blood：PU.1编码基因所在染色质区域的动态三维结构
中心点：PU.1编码基因的空间染色质结构，在髓系分化过程中动态重构，在AML中被破坏。PU.1自动调节启动空间重构，并招募LDB1来稳定PU.1基因调控DNA元件之间所形成的染色质环。摘要：基因表达的表观遗传调控发生在被称为拓扑关联域(TADs)的离散空间染色体单元内，但大多数基因的精确的空间要求尚未明确；该点对与癌症相关的基因特别有意义。Daniel Schuetzmann等人采用高分辨率的染色
MedSci原创 - PU.1，三维结构，拓扑关联域，LDB1 - 2018-10-14
Nature：组蛋白H1缺失破坏染色质3D结构，驱动淋巴瘤发展
研究人员还确立了H1作为一种真正的肿瘤抑制因子，并表明H1的突变主要通过三维基因组重组驱动恶性转化，从而导致表观遗传学重编程和发育沉默基因的去抑制。
MedSci原创 - 淋巴瘤，基因组 - 2020-12-10
Circulation：广泛的染色质重塑会增加心衰的风险
既往研究表明心血管疾病与患者心脏的表观遗传改变有关，然而，心肌细胞的内源性染色质结构目前尚未阐明。本研究在压力负荷诱导心肌细胞肥大的成人心脏组织中进行全基因组染色体构象捕获（Hi-C）和DNA测序。此外，构建心脏特异性敲除CTCF（普遍存在染色质的一种结构蛋白）小鼠模型，研究CTCF蛋
MedSci原创 - 心衰，染色质重塑，表观遗传 - 2017-08-13
Blood：异染色质极端破坏会加速造血系统衰老
异染色质丢失一直被认为是不同物种、不同类型细胞衰老的一个普遍机制。然而，目前对于异染色质丢失所引起的造血系统改变的综合分析还有待研究。此外，既往研究报道的在衰老过程中主要的异染色质组蛋白甲基转移酶Su
MedSci原创 - 造血细胞，异染色质，Suv39h1，Suv39h2 - 2020-04-22
Nat Commun：cohesin帮助重构衰老中的染色质环
研究人员使用Hi-C技术发现，致癌性RAS诱导的人类二倍体成纤维细胞的衰老伴随着广泛的增强子-促进子重新布局，这与cohesin动态结合到基因组密切相关。
MedSci原创 - 细胞衰老 - 2020-11-28
Circulation：染色质的CTCF环参与心衰应激性基因表达
在细胞核中，人类基因组具有三维空间结构，折叠形成数千个染色质环，包裹基因和顺式调控元件，以精准调控基因表达。染色质环由DNA结合蛋白CTCF和内聚蛋白环复合物锚定。鉴于心衰存在标志性的基因表达变化，近期有研究报道，CTCF相关的染色质重组是心肌应激性基因表达的基础，与CTCF敲除过程中所发生的染色质结构域边界的变化一致。研究人员采用心肌压力超负荷的小鼠模型和特异性敲除心肌Ctcf的小鼠模型，对染色
MedSci原创 - CTCF，染色质，心衰，应激反应 - 2019-04-21
IVD前沿丨PBMC染色质特征作为肿瘤诊断新工具
PBMCs染色质特征可区分健康患者和癌症患者以及不同的肿瘤组，也可以用于评估晚期肿瘤质子治疗的治疗效果，从而显示了染色质生物标志物在诊断和治疗评估中的临床应用潜力。
小桔灯网 - PBMC，肿瘤，染色质 - 2024-03-07
Blood：APL细胞外染色质使凝血及纤溶恶化
急性早幼粒细胞白血病（APL）常伴发危及生命的血栓及出血。尽管在过去的几十年中， APL缓解率已达90%，成为高度可治愈型人类恶性肿瘤。但是，多个以总体人群为基础的大型高水平临床研究表明，APL患者的早期死亡率仍高达17-30%，且凝血紊乱并发症占早期死亡原因的40-65%，成为后ATRA时代提高APL治愈率的主要阻碍。
科学网 - APL - 2017-04-11
NBT：任兵团队开发新型高通量单细胞染色质构象分析技术Droplet Hi-C，填补异质组织染色质分析的关键空白
研究团队介绍了一种高度可扩展的、基于液滴的单细胞Hi-C方法——Droplet Hi-C，它可使用商业微流体装置在液滴中进行高通量单细胞染色质构象分析。
测序中国 - 高通量单细胞染色质构象分析，Droplet Hi-C - 2024-11-05
Nature:染色质组织方式决定肿瘤细胞区域性突变率
7月22日，Nature杂志在线报道，染色质组织方式对人类癌细胞中区域性突变率具有重大影响。 癌症基因组测序，提供了人类体细胞整个基因组的基因突变率差异的第一手资料。通过检测各种遗传学和表观遗传学指标，研究者发现，癌症细胞基因组的基因突变率与染色质组织方式存在惊人的相关性。事实上，在百万碱基数量级上，一个单一的染色质组织特性（异染色质相关组蛋白修饰H3K9me3的水平），可以导致40％以上的
生物谷 - 染色质，肿瘤细胞，区域性，突变率 - 2012-07-25
Nature：肿瘤代谢物破坏染色质信号，抑制DNA修复
研究人员表明，抑癌代谢物诱导的赖氨酸脱甲基酶KDM4B的抑制，导致组蛋白3赖氨酸9（H3K9）在DNA断裂周围位点的异常超甲基化，掩盖了对HDR的正确执行至关重要的局部H3K9三甲基化信号。
MedSci原创 - 肿瘤，代谢，DNA损伤修复 - 2020-06-11
Cell：染色质“接吻”能调控基因的表达
一项突破性的研究发现将对我们了解我们的遗传蓝图 DNA 的功能产生重大的影响，来自南非的科学家们第一次揭示了，当基因在三维空间中互作，或可说是参与“基因接吻”（gene kissing）时，对于细胞内的基因开启会造成重大的影响。这一里程碑式研究发现发表在世界最著名的研究期刊《细胞》（Cell）杂志上。 “基因接吻”是基因激活的原因或只是一个结果，是一个长期存在的生物学问题。来自南非金山大
MedSci原创 - 染色质 - 2013-11-20
染色质免疫沉淀(ChIP)实验指南及技术总结
染色质免疫沉淀(ChIP)实验指南及技术总结ChIP是一项比较流行的研究转录因子（ transcription factor, TF）与启动子（promoter）相互结合的实验技术。
染色质免疫沉淀 - 2016-05-09
Nat Gene:染色质重塑异常可能导致膀胱癌
日前，由北京大学深圳医院和华大基因研究院共同完成的一项研究发现，染色质重塑异常可能是导致膀胱癌发生的一个重要原因，这为膀胱癌的诊断、治疗奠定了遗传学基础。
染色质重塑，膀胱癌 - 2011-11-28
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