Nature:癌症基因组图谱计划完成
在美国大型癌症基因组计划告一段落后,卵巢癌是还将进行集中测序的若干肿瘤类型之一 美国一项从遗传学角度描述1万个肿瘤的庞大计划日前正式落下帷幕。作为在2006年开始的一个斥资1亿美元的试点项目,癌症基因组图谱(TCGA)如今是国际癌症基因组联盟中最大的组成部分,该联盟由来自16个国家的科学家组成,已经发现了近1000万个与癌症相关的基因突变。
《中国科学报》 - 癌症,基因组,图谱 - 2015-01-07
Nature Genetics:HPV全基因组整合图谱分析
来自华中科技大学、南方医科大学、华大基因研究院等机构的研究人员,通过对宫颈癌(cervical cancer)进行全基因组人类乳头瘤病毒(HPV)整合图谱分析,鉴别出了一些成簇的基因组热点,并揭示出了由微同源
生物通 - HPV,宫颈癌 - 2015-01-20
首个亚洲家猪 “超清” 基因组图谱发布
近日,生物学预印本服务器(BioRxiv)在线发表了中国优良地方猪——陆川猪的染色体级别的高质量定相(Phased)基因组序列。这不仅填补了亚洲家猪缺少高质量参考基因组的空白,更为基因组组装提供了新的方向。该项成果由中国农业科学院深圳农业基因组研究所(以下简称 “基因组所”)猪基因组设计育种创新团队主导完成。
中国科学报 - 基因组图谱 - 2019-10-09
Nature Microbiology:克氏锥虫全基因组图谱分析
本文数据显示,胰蛋白酶体基因组被组织成染色质折叠结构域,转录受到局部染色质结构的影响。我们提出了一个表观遗传机制影响锥体基因表达的模型。
MedSci原创 - 全基因组,克氏锥虫 - 2023-11-11
Genes Dev:美科学家绘制全基因组DNA修复图谱
近日,来自美国的科学家开发出一种方法,能够在全基因组范围内精确定位DNA损伤修复位点。这一研究进展发表在国际学术期刊Genes & Developm
生物谷 - 癌细胞,DNA - 2015-05-07
全面基因组测序:全面解析不同亚型泌尿系统肿瘤基因图谱
明确肿瘤的基因组学特征,可以探寻潜在的治疗靶点。在刚刚落幕的ASCO大会上,多项研究采用全面基因组测序(CGP检测)检测泌尿系统肿瘤的基因图谱,探寻可能从靶向或免疫治疗中获益的人群。
肿瘤资讯 - 全面基因组测序,不同亚型,泌尿系统,肿瘤,基因图谱 - 2019-06-14
香港中文大学率先成功破解鼻咽癌全基因组图谱
香港中文大学(中大)7日公布,其医学院研究人员率先成功破解鼻咽癌全基因组图谱,这是在全球已公布的研究中,首个有系统地进行鼻咽癌全基因组测序分析的研究。
中国新闻网 - 鼻咽癌,基因图谱 - 2017-03-08
EHA 2024 | 最新摘要抢先看:基因组光学图谱技术(OGM)解析急性T淋巴细胞白血病基因组结构变异
OGM技术能够同时分析同一标本中的CNV和SV,且与SNP-a数据相比,两者在CNV检测上具有高度一致性。
MedSci原创 - 急性T淋巴细胞白血病,EHA 2024,基因组光学图谱技术 - 2024-05-21
世界上最大最全面的正常乳腺单细胞基因组图谱发布!
该研究创造了世界上最大最全面的正常乳腺组织图谱,提供了一个前所未有的乳腺生物学,可能有助于识别如乳腺癌等治疗目标。
转化医学网 - 乳腺单细胞基因组图谱 - 2023-07-09
Cell Genomics | 开放的儿童脑肿瘤图谱OpenPBTA,加速基因组发现与转化
该图谱的分析框架具有分析代码审查和持续集成等特性,拥有40多个可扩展的分析模块,从而确保在项目整个生命周期中的可重复性。
测序中国 - 儿童脑肿瘤图谱,OpenPBTA - 2023-07-09
CLIN CHEM:羊水胎儿基因组的全基因组测序和分析
羊膜穿刺术是一种常见的手术,其主要目的是从胎儿收集细胞对异常染色体、染色体拷贝数的改变、少量单基因至多基因缺陷进行测试,。在这里,研究人员展示了从羊水样品的细胞或游离DNA(cfDNA)对胎儿进行精确全基因组分析的可行性。使用Complete Genomics nanoarray平台,对从31个羊膜组织中分离出的cfDNA和DNA进行测序,基因组覆盖率为50×。在一部分样品中,从分离自细胞
MedSci原创 - 羊水,胎儿,基因组 - 2018-04-04
Science Translational Medicine:用于幼儿期人类小脑成熟的单细胞基因组图谱
一个整合了细胞类型特异性基因表达和染色质可及性的基因调节网络模型确定了浦肯野神经元中的七个时间特异性基因网络,并表明炎症可能与发育基因表达计划的过早下调有关。
MedSci原创 - 小脑,幼儿期,单细胞基因组图谱 - 2023-11-15
Nature:孙颖浩教授研究组最新发布亚洲人前列腺癌基因组图谱
通过对2554例前列腺肿瘤的系统比较,绘制了亚洲人群前列腺癌基因图谱,研究表明中国患者的基因组突变特征与西方患者明显不同。
生物通 - 前列腺癌,基因组图谱,亚洲人 - 2020-03-28
Biomicrofluidics:利用时间序列数据高准确率地绘制基因组图谱
如果你已经有了一种有机体的基因组序列图谱,但想在图谱中找到异常结构,那么你可以通过在一些靶点中切断DNA序列并检测切割点之间的距离来检查基因条码。然而,原始基因图谱在允许研究有系统误差存在的情况下可通过新一代测序技术如PCR获得(包括任何扩增偏差)。为了补救这样的情况,明尼苏达大学和生物纳米基因组学的研究人员研究通过使用动态时间序列数据来测量以纳米通道为基础的图谱形式的概率分布。 “想象DN
不详 - 基因组,图谱,时间序列 - 2016-01-06
蛋白质基因组学:运用蛋白质组技术注释基因组
随着高通量DNA测序技术的飞速发展,越来越多的物种完成了基因组测序.定位编码基因、确定编码基因结构是 基因组注释的基本任务,然而以往的基因组注释方法主要依赖于DNA及RNA序列信息.为了更加精确地解读完成测序的基因组,我们需要整合多种类型的组学数 据进行基因组注释.近年来,基于串联质谱技术的蛋白质组学已经发展成熟,实现了对蛋白质组的高覆盖,使得利用串联质谱数据进行基因组注释成为可
生物化学与生物物理学进展 - 亚硝基化谷胱甘肽还原酶,GSNOR,NO,炎症因子 - 2014-01-03
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