Epigenetics Chromatin:巨噬细胞活化期间转录增强子的全基因组谱分析
通过对基因表达和表观遗传数据的分析,研究人员确定了骨髓源性巨噬细胞的大规模转录增强子,其时间动力学和靶蛋白编码基因。研究观察到靶基因表达的增加,伴随着相关增强子数量的增
MedSci原创 - 2017-11-03
Eur Urol:前列腺癌的全基因组和转录组测序发现新的驱动疾病进展的基因改变。
前列腺癌发病率的全球差异突显了在不同种族人群中确定前列腺肿瘤的基因组异常的迫切性。近期研究者便针对亚洲人群开展了这一研究。旨在系统地探索前列腺癌基因的复杂性和定义驱动疾病进展的基因改变。
MedSci原创 - 前列腺癌,全基因组测序,转录组测序,疾病进展,PCDH9,PLXNA1 - 2017-09-21
Blood:血小板和iPSC来源的巨核细胞的全基因组转录图谱和RNA测序
GWAS研究已经明确了与血小板相关表型相关的常见变异,但由于这些变异主要位于内含子中或基因间,它们与血小板生物学特征的相关性尚不清楚。
MedSci原创 - 血小板,巨核细胞,数量性状位点(eQTL) - 2020-11-02
Nature:基于空间分辨转录组学分析良、恶性组织拷贝数状态,揭示全基因组CNV的独特克隆模式
研究团队对前列腺器官进行了深入的空间分析,生成了一个前所未有的图谱,包含单个患者多达50000个组织结构域以及10个患者约120000个组织结构域。
测序中国 - 全基因组,克隆模式 - 2022-08-28
ceRNA:从全新的视角研究转录组
当我们谈到基因表达,自然离不开microRNA(miRNA)。这一类小小的非编码RNA通过与mRNA目标结合,抑制其翻译成蛋白质,从而在胚胎发育、细胞分化以及器官形成等过程中发挥重要作用。然而,事情并非如此简单。单个mRNA可能受到多个miRNA的调控,而单个miRNA能够调控多个mRNA。mRNA与miRNA之间的串扰(crosstalk)是如此复杂,又如此迷人,引无数学者竞折腰。 miR
生物通 - ceRNA,转录 - 2016-09-18
Cell Research :汤富酬/乔杰/王晓群合作组首次绘制人类胚胎大脑全皮层转录组图谱并揭示区域发育异质性
https://www.nature.com/articles/s41422-018-0053-3
BioArt - 汤富酬/乔杰/王晓群合作组首次绘制人类胚胎大脑全皮层转录组图谱并揭示区域发育异质性 - 2018-06-06
Circulation:单细胞转录组学揭示不同器官内皮细胞的转录特征
虽然这些功能上的差异可能被记录在转录组中,但维持EC异质性的通路和网络尚未完全明确。
MedSci原创 - 内皮细胞,转录组,单细胞RNA测序 - 2020-09-19
PNAS:上夜班使你的转录组失调
内源性昼夜节律系统的错位会导致生理节律的破坏,并可能导致与夜班工作相关的健康损害的发展。然而,这背后的分子基础仍有待阐明。
MedSci原创 - 夜班,昼夜节律,转录 - 2018-05-09
Nat Commun:全转录组关联分析揭示人类DNA中的“化石病毒”为重大精神疾病的新风险因素
该研究使用TWAS方法对五种主要精神疾病进行逆转录组推断,利用了从大量人群样本中获得的RNA测序和基因数据。
测序中国 - 精神分裂症,双相情感障碍,重性抑郁障碍,人类内源性逆转录病毒 - 2024-06-22
AJHG:基于超3千个体血浆蛋白质组的全转录组关联分析,揭示复杂性状背后的顺式和反式调节机制
研究团队使用跨组织基因表达预测揭示了影响血浆蛋白质组的调控特征,发现影响基因表达的遗传因素也为了解血浆蛋白质组和相关性状提供了窗口。
测序中国 - 血浆蛋白质组,基因表达 - 2024-03-14
Clini Cancer Research:Hu14.18-IL2免疫治疗后肿瘤组织的全转录组测序分析鉴定预后相关生物标志物
hu14.18-IL2(EMD 273063)是一种抗GD2免疫因子,由抗GD2抗体14.18(抗体)和两分子的IL-2(免疫因子)融合而成的蛋白,主要用于治疗黑色素瘤。
MedSci原创 - 黑色素瘤,肿瘤浸润淋巴细胞,hu14.18-IL2,全转录组测序 - 2020-07-05
浙江成功完成寨卡病毒全基因组测序并发布全序列
浙江省疾控中心2月27日发布消息称,浙江省已经成功完成寨卡病毒全基因组测序并发布全序列,为寨卡病毒疫情防控奠定基础。
中国新闻网 - 寨卡,病毒,基因组 - 2016-02-29
Blood:遗传-转录组学分析明确关键转录因子是人红白血病的驱动因素
急性红细胞白血病(AML-M6或AEL) 是一种罕见的侵袭性血液恶性肿瘤。既往研究表明,AEL白血病细胞通常携带已知的AML相关癌基因的复杂核型和突变。
MedSci原创 - 转录因子,急性红细胞白血病,AML-M6 - 2020-05-12
单细胞转录组研究进展
单细胞转录组分析以单个细胞为特定研究对象,提取mRNA进行逆转录、放大和高通量测序分析,能揭示该细 胞内整体水平的基因表达状态和基因结构信息,准确反映细胞间的异质性,深入理解其基因型和表型之间的相互关系,在发育生物学、基础医学、临床诊断和药物开 发等领域都发挥重要作用.本文主要介绍了单细胞转录组分析的特点和技术发展历史以及常用研究策略和不同技术的优缺点,并就其面临挑战
生物化学与生物物理学进展 - 转录组,单细胞转录组 - 2014-01-03
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