Nat Commun:基于单细胞和空间转录组学分析构建NSCLC免疫和非免疫区图谱
研究团队将来自25名未接受治疗LUAD或LUSC患者的近90万个细胞的scRNAseq数据和其中8名患者的空间转录组学数据结合起来,系统研究了肿瘤和邻近非肿瘤组织中细胞组织的差异。
测序中国 - NSCLC,肺癌,空间转录组学 - 2024-06-18
Nature:癌症基因组图谱计划完成
在美国大型癌症基因组计划告一段落后,卵巢癌是还将进行集中测序的若干肿瘤类型之一 美国一项从遗传学角度描述1万个肿瘤的庞大计划日前正式落下帷幕。作为在2006年开始的一个斥资1亿美元的试点项目,癌症基因组图谱(TCGA)如今是国际癌症基因组联盟中最大的组成部分,该联盟由来自16个国家的科学家组成,已经发现了近1000万个与癌症相关的基因突变。
《中国科学报》 - 癌症,基因组,图谱 - 2015-01-07
全新人类脑图谱---大脑连接组图谱被中国科学家绘成
中国科学院自动化所脑网络组研究中心蒋田仔团队联合国内外其它团队通过6年的努力,成功绘制出全新的人类脑图谱:脑网络组图谱。该图谱包括246个精细脑区亚区,以及脑区亚区间的多模态连接模式,突破了100多年来传统脑图谱绘制思想,引入了脑结构和功能连接信息对脑区进行精细划分和脑图谱绘制的全新思想和方法,比传统的Brodmann图谱精细
中国科学院自动化研究所 - 人类脑图谱,脑标本,神经纤维 - 2016-06-20
Nature:癌症免疫逃逸基因图谱
在过去的十年中,不同形式的免疫治疗已经成为真正有效的癌症治疗方法,以PD-1/PD-L1抑制剂为代表的癌症免疫疗法彻底改变了癌症领域。然而,免疫治疗只在一部分患者中产生持久反应。
Bio生物世界 - 癌症,基因图谱,免疫逃逸 - 2020-09-25
Nature Genetics:HPV全基因组整合图谱分析
来自华中科技大学、南方医科大学、华大基因研究院等机构的研究人员,通过对宫颈癌(cervical cancer)进行全基因组人类乳头瘤病毒(HPV)整合图谱分析,鉴别出了一些成簇的基因组热点,并揭示出了由微同源
生物通 - HPV,宫颈癌 - 2015-01-20
首个亚洲家猪 “超清” 基因组图谱发布
近日,生物学预印本服务器(BioRxiv)在线发表了中国优良地方猪——陆川猪的染色体级别的高质量定相(Phased)基因组序列。这不仅填补了亚洲家猪缺少高质量参考基因组的空白,更为基因组组装提供了新的方向。该项成果由中国农业科学院深圳农业基因组研究所(以下简称 “基因组所”)猪基因组设计育种创新团队主导完成。
中国科学报 - 基因组图谱 - 2019-10-09
Nat Med:张泽民研究组与合作者发表单细胞水平的肺癌 T 淋巴细胞免疫图谱
考虑到肿瘤微环境的复杂性,近年来单细胞转录组测序技术逐渐被广泛应用于肿瘤浸润免疫细胞的研究当中。
生物360 - 非小细胞肺癌,基因诊断l,图谱 - 2018-06-27
Nature:细胞图谱揭示免疫系统抗击癌症新细节
发表于5月4日的两项研究提出,绘制围绕肿瘤的免疫细胞的详细图谱能帮助人们发现新的治疗靶标,找出可用于选择某种疗法最有可能对其起效的病人的生物标记物,还能帮助了解何时是开始治疗的最佳时机。
Nature自然科研 - 免疫,癌症 - 2017-06-08
Nature Microbiology:克氏锥虫全基因组图谱分析
本文数据显示,胰蛋白酶体基因组被组织成染色质折叠结构域,转录受到局部染色质结构的影响。我们提出了一个表观遗传机制影响锥体基因表达的模型。
MedSci原创 - 全基因组,克氏锥虫 - 2023-11-11
Science:开发出TT-Seq技术绘制人类瞬时转录组图谱
基因之间的序列长期以来被视为“垃圾DNA”,我们如今知道它们也发挥着至关重要的功能。这些DNA区域发生的突变能够严重地对人类发育造成损害,而且可能在生命后期导致严重疾病。然而,在此之前,调节性DNA序列一直很难发现。如今,在一项新的研究中,德国慕尼黑理工大学计算生物学教授Julien Gagneur团队和德国马克斯普朗克生物物理化学研究所教授Patrick Cramer团队如今开发出一种方法可
生物谷 - TT-Seq技术,人类瞬时转录 - 2016-06-04
Cell Reports︱汤富酬研究组与合作者绘制人类肾脏发育单细胞转录组图谱
肾脏是人体最重要的内脏器官之一,对维持机体的酸碱平衡,调节水盐代谢,排泄代谢废物以及调节血压等方面都具有重要作用。过去几十年来基于小鼠模型的研究,已经相对完整地揭示了哺乳动物胚胎期肾脏的发育过程。然而由于小鼠和人类物种间差异的存在,长期以来对于人类胚胎期肾脏发育过程始终没有得到很好的说明,特别是关于肾脏发育过程中一些重要细胞类型的起源及其功能、以及参与完整肾单位发育成熟的分子调控机制等方面都亟待进
细胞 - 绘制,人类,肾脏,发育单细胞,转录组图谱 - 2018-09-28
Genes Dev:美科学家绘制全基因组DNA修复图谱
近日,来自美国的科学家开发出一种方法,能够在全基因组范围内精确定位DNA损伤修复位点。这一研究进展发表在国际学术期刊Genes & Developm
生物谷 - 癌细胞,DNA - 2015-05-07
Nat Med:多组学方法绘制结直肠癌肿瘤、免疫和微生物综合图谱,揭示微生物组与免疫系统的相互作用
该研究使用的多组学方法能够彻底检测分析结直肠癌免疫反应的分子特征,并揭示微生物组与免疫系统之间的相互作用。
测序中国 - 结直肠癌肿瘤 - 2024-04-29
脑网络组图谱:人类认识脑和脑疾病的利器
蒋田仔 中国科学院自动化研究所脑网络组研究中心主任 脑是人体最为复杂的器官。长期以来,人类对脑的结构和功能进行了大量的研究。如果想知道大脑是如何工作的,就必须有一个脑图谱,为复杂的脑部研究进行“导航”。因此,脑图谱一直以来都是研究脑结构和功能及脑疾病的重要手段。
《中国科学报》 - 脑网络,脑疾病 - 2015-07-10
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