Nature子刊 | 浙江大学阮一骏等团队合作开发新的方法，用于低细胞输入的3D表观基因组的绘制
通过使用ChIA-PET，Hi-C及其衍生物的近距离连接，染色质相互作用的全基因组图谱已经能够将基因与它们的顺式调控元件连接起来。
iNature - 3D表观基因组，低细胞输入 - 2023-01-16
Protein & Cell：王永成/樊龙江团队合作开发微生物组单细胞转录组测序技术
该研究建立了基于随机引物的高通量单细胞RNA测序技术及其数据分析方法，首次实现了复杂微生物组样本的高通量单细胞转录组测序与分析。
测序中国 - 微生物组，单细胞转录组测序 - 2024-06-01
Cell：单细胞测序+蛋白质组成像，绘制迄今最全面的空间分辨健康人类骨髓图谱
该研究发现了多种非造血细胞亚型，揭示了人类骨髓中非造血细胞和造血细胞的重要性和相互作用，以及早期骨髓造血过程中特定细胞类型的空间分布。
测序中国 - 急性髓系白血病，骨髓，单细胞RNA测序，非造血细胞，骨髓生态位 - 2024-06-21
Cell Research：孙颖浩发现中国人群前列腺癌特异融合基因
第二军医大学长海医院孙颖浩教授运用RNA-seq技术首次对中国人前列腺癌及癌旁组织进行系统研究，发现新型融合基因、癌相关长链非编码RNA、异构体和点突变。
Cell Research - 肿瘤，癌症 - 2012-04-10
Immunity：细胞微环境可以影响炎症细胞的基因表达、调节免疫反应！
人体通过先天免疫细胞（如巨噬细胞）应对发育及稳态调解过程中遇到的多种刺激，其转录可塑性是它实现复杂功能的基础。这种基因表达的动态变化不仅由遗传谱系决定，还取决于启动子、增强子等转录因子的表达变化。
生物探索 - 免疫细胞，巨噬细胞 - 2021-06-29
Nat Biotechnol：证实CRISPR/Cpf1基因组编辑几乎没有脱靶效应
作为CRISPR基因组编辑的新工具，Cpf1因其不同于Cas9的性质而引起人们的广泛关注。它只需要单个RNA，即crRNA（CRISPR RNA），因而组装更加简单；它的交错切割模式可能促进利用所需的序列替换现有的DNA序列；它识别富含胸腺嘧啶的DNA序列，而且相对于Cas9识别的富含鸟嘌呤的序列，人们很少探讨这种序列。总之，Cpf1有望扩大CRISPR基因组编辑靶位点的范围，同时具有更好的编辑效
生物谷 - 转化医学，基因编辑 - 2016-06-07
Nature Methods：MIT开发出便携、低成本的单细胞RNA测序新手段
每个细胞的基因表达谱随其功能而异。从血液或组织样本中的许多单个细胞中提取RNA可以根据基因表达模式区分细胞。这使科学家有机会确定细胞功能，包括它们在疾病中的作用或对治疗的反应。
生物探索 - RNA测序，MIT，单细胞 - 2017-02-20
Nature Methods：便携、低成本的单细胞RNA测序新手段
新的技术被称为Seq-Well，可以让科学家在组织样本中更容易识别不同类型的细胞，帮助他们研究免疫细胞如
生物探索 - 单细胞，RNA，测序 - 2017-02-20
曾庆平：“蓝带”区域大量百岁老人关键长寿秘密
“蓝带”或译“蓝区”（blue zone）一词见于M. Poulain等在2004年发表在《实验老年病学》（Exp Gerontol）杂志上的一篇关于意大利撒丁岛百岁老人的调查报告（AKEE_BZ_Draft_Nov2003.pdf），系因作者在地图上该长寿区画的一个蓝色圆圈而得名（下图）。上图中的“蓝带”位于撒丁岛的中东部，靠近海边，为海拔588米（非“蓝带”地区为142米）的山区和高地，当
科学博客 - 长寿，蓝带 - 2015-05-01
Nat Commun：研究揭示了促血管生成的新的细胞自主调控机制
血管扩张在许多生理和病理环境中起着调节血管的作用，血管生成需要内皮细胞行为的动态变化。然而，目前在血管生长、重塑、成熟和静止期的不同阶段，关于内皮细胞活性的分子机制仍尚未清楚。本研究中，研究人员表征了小鼠出生后发育过程中的动态基因表达的变化，并确定了小鼠视网膜内皮细胞中的关键血管生成因子。通过积极翻译转录组分析和硅片计算分析，研究人员确定了控制不同发育阶段过程中调节血管内皮细胞行为的候选调节因子。
MedSci原创 - 血管生成，内皮细胞 - 2017-10-11
Nat Methods：利用ATAC-see技术可视化观察易接近的染色质
这正是Chang开发一种被称作ATAC-seq（Assay for Transposase-Accessible Chromatin with highthroughput sequencing, 利
生物谷 - ATAC-see技术 - 2017-01-09
Hypertension：老年收缩期高血压患者sacubitril /缬沙坦与奥美沙坦疗效比较
在PARAMETER研究（在老年动脉硬化患者中血管紧张素受体脑啡肽酶抑制剂与血管紧张素受体拮抗剂疗效的前瞻性比较）中首次证明sacubitril/缬沙坦比奥美沙坦在降低老年收缩期高血压和动脉硬化患者诊所和动态中心动脉压和肱动脉压方面更加有优势。
MedSci原创 - 高血压 - 2017-01-19
JCEM：全基因组DNA低甲基化增加在甲状腺癌中扮演何角色？
尽管现在大家都知道全基因组DNA低甲基化是很多癌症发生发展的主要原因之一，但其在甲状腺癌中的作用还不清楚。因此，2017年11月20日在JCEM上发表的一篇文章则研究了其在甲状腺癌进展中所扮演的角色及其作为预后标记物的可能性。
MedSci原创 - 全基因组DNA，低甲基化，甲状腺癌 - 2017-11-21
Genome Biol：RNA印记法（RNA footprinting）用于转录组分析
生物学家们逐渐意识到，RNA不只是DNA和蛋白之间的过渡产物，它对调节基因的表达有重要作用。深入研究RNA调控，能够帮助科学家们进一步理解相关疾病。 宾夕法尼亚大学的科学家们开发了分析RNA调控的新方法，这一方法能够有效获得RNA与RNA结合蛋白（RBP）互作的所有位点。这一发表在Genome Biology杂志上的文章，不仅鉴定了RBP结合位点中的重要基因突变，还为其他RNA研究者提供了路线图。
MedSci原创 - 印记，RNA印记 - 2014-01-10
Obstet Gynecol：出生时从新生儿缺氧缺血性脑病中鉴别出动脉缺血性脑卒中的方法
因此，研究数据表明新生儿脑卒中与增加的初始血小板计数有关，而与剖宫产不安全的胎心率曲线、突发事件或围产期代谢性酸中毒无关。脑卒中是一种不与围产期危险因素无关的新生儿脑损伤，这样可以允许对其进行早期识别。
MedSci原创 - 缺血性脑卒中 - 2016-09-25
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