Nature Genetics:BANKSY:革命性算法,重塑空间组学数据分析
该算法作为一种创新的空间组学数据分析工具,其主要功能是将空间组学数据中的细胞根据类型和组织域进行有效分类。
生物探索 - 空间组学,BANKSY - 2024-03-04
中国科学院:生物组学数据库获国际认可
记者12月20日从中国科学院北京基因组研究所获悉,该所生命与健康大数据中心(BIGD)建成的生物组学数据库首次获得国际认可。BIGD团队近日在国际学术期刊《核酸研究》上发表研究论文《北京基因组研究所生命与健康大数据中心:从存储到整合、再到转化》,这是中国首次以数据中心的模式,整体发布中国生物组学数据资源的建设情况。论文作者之一、中科院北京基因组研究所研究员章张解释,“组学”是指将基因、蛋白及代谢物
中国新闻网 - 中国科学院,生物组学数据库,获国际认可 - 2016-12-21
Science Translational Medicine:单细胞转录组学鉴定体内HIV-1的原胸腺酶α限制
本文研究结果确定原胸腺酶α是体内限制HIV-1感染的宿主因子,这对病毒传播和治疗策略具有重要意义。
MedSci原创 - HIV-1,单细胞转录组学 - 2023-08-30
大规模国人基因组学大数据研究成果公布
10月10日,华大在深圳国家基因库正式对外发布一项迄今为止最大规模的中国人基因组学大数据研究成果。这是由中国科学家主导,历时两年,对14余万中国人的无创产前基因检测数据进行深入研究后,首次揭秘中国人群基因遗传特征的科研成果,也是由华大主导的“百万人群基因大数据研究”项目的首秀。
科技日报 - 基因组学 - 2018-10-11
Genome Res:变分图卷积自编码器框架——PAST,可融合外部参考数据进行空间转录组数据降维分析
该模型不仅可以有效提取空间转录组数据的低维表示特征,辨识空间功能区域(Spatial Domains),还能够促进数据可视化、发育轨迹推断和伪时序分析等多种下游任务。
测序中国 - 空间转录组 - 2023-11-09
A&R:具有组织学和临床相关性的青少年局部硬皮病皮肤的转录组学评价
这项研究是采用RNA测序(RNA-Seq)比较患青少年LS的儿童皮肤活检组织与健康儿童对照的转录组差异.
MedSci原创 - 2021-10-08
European Radiology:胰腺导管腺癌的转录亚型与CT放射组学评分的相关性
放射组学是一种非侵入性的影像学方法,用于从医学图像的感兴趣区域提取多维信息。之前的试点研究表明,使用基于CT的放射组学模型对PDAC进行亚型分析有一定的诊断价值。
MedSci原创 - 胰腺导管腺癌,放射组学 - 2023-02-02
Nature Microbiology:microbeMASST——微生物代谢组学数据的分类学信息质谱搜索工具
通过利用公共数据的力量,我们可以解锁在多个领域取得进步的机会,并加深我们对微生物及其生态系统之间复杂关系的理解。
MedSci原创 - microbeMASST,微生物代谢组学 - 2024-02-23
PLOS ONE:西方饮食诱导的非酒精性脂肪性肝炎的脂质组学和转录组学分析
非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)是世界上最常见的慢性肝病,特别是在肥胖和2型糖尿病患者中。 NAFLD的严重程度范围可以从良性脂肪变性到非酒精性脂肪性肝炎(NASH),NASH还可以发展为肝硬化,原发性肝细胞癌(HCC)和肝功能衰竭。因此,NAFLD已成为一个主要的公共卫生问题。
MedSci原创 - 西方饮食,非酒精性脂肪肝 - 2019-04-05
Nat Commun:肾脏转录组、蛋白质组和多组学的遗传估算阐明了新的血压和高血压目标
本研究通过肾脏层面的遗传调控机制揭示了血压调节的新理解,为未来个性化治疗和药物研发提供了重要的指导。
MedSci原创 - 高血压,蛋白质组,肾脏转录组 - 2024-03-21
NATURE:历时十年,最大人类蛋白互作组学数据发布
HuRI涵盖约53,000蛋白质-蛋白质相互作用。比起高质量的小规模研究的相互作用,HuRI有大约四倍的这种相互作用。
MedSci原创 - 蛋白质组学 - 2020-04-10
ceRNA:从全新的视角研究转录组
当我们谈到基因表达,自然离不开microRNA(miRNA)。这一类小小的非编码RNA通过与mRNA目标结合,抑制其翻译成蛋白质,从而在胚胎发育、细胞分化以及器官形成等过程中发挥重要作用。然而,事情并非如此简单。单个mRNA可能受到多个miRNA的调控,而单个miRNA能够调控多个mRNA。mRNA与miRNA之间的串扰(crosstalk)是如此复杂,又如此迷人,引无数学者竞折腰。 miR
生物通 - ceRNA,转录 - 2016-09-18
【Leukemia】诊断后两年内复发的DLBCL患者的遗传学和转录组学分析
为进一步了解耐药和疾病进展的机制,并开发用于识别发生早期R/R风险患者的分子学工具,天津医科大学肿瘤医院张会来教授团队联合瑞典卡罗林斯卡医学院、乌普萨拉大学和华大基因共同开展一项研究。
聊聊血液 - R-CHOP,弥漫性大B细胞淋巴瘤 - 2024-01-02
中国发布脑胶质瘤组学数据 将向全球免费开放
8日,记者从首都医科大学附属北京天坛医院了解到,中国脑胶质瘤基因组图谱计划(CGGA)数据库近日发布2000例中国脑胶质瘤样本的功能基因组学数据。经过15年的临床标本和组学数据积累,目前该数据库日臻完善,全部基因组数据向全世界研究者免费开放。据不完全统计,已有美国、欧洲多家知名研究机构近200篇SCI论文引用该数据库。CGGA发起人和创建者、北京天坛医院神经外科副主任江涛介绍,此次公布的数据涉及不
科技日报 - 脑胶质瘤组学 - 2019-07-09
Front Pharmacol:通过转录组学和网络特征预测前列腺癌的协同药物组合研究
在过去的几十年里,药物开发一直以一个靶标对应一个药物的策略为主。尽管靶向治疗极大地改变了癌症的治疗方法,但将药物局限于单一靶点的做法缺乏考虑致病因素的复杂性。此外,由于基因的异质性变异和功能冗余,癌细
MedSci原创 - 药物,前列腺癌,预测模型 - 2021-05-30
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