European Radiology:联合放射组学和转录组学分析揭示了非小细胞肺癌的亚型特征
一些优秀的放射基因组学研究发现,放射基因组学可以帮助预测NSCLC的突变状态。
MedSci原创 - 非小细胞肺癌,转录组学,放射组学 - 2023-05-13
Cancer Cell:基于上千例泛癌多组学数据,CPTAC发布蛋白基因组学共享数据资源
该文章概述了CPTAC泛癌研究团队在数据协调、数据传播和帮助生物发现的计算资源方面所做出的努力,并讨论了多组学数据整合和分析的挑战。
测序中国 - 泛癌多组学,蛋白基因组学 - 2023-08-30
NAR:深圳国家基因库/华大生命科学研究院发表空间转录组学数据共享、分析和可视化综合数据库STOmicsDB
文章介绍了一站式空间转录组学数据库STOmicsDB,有助于空间转录组学领域的数据存档、共享、可视化和分析。
测序中国 - 空间转录组学,可视化综合数据库 - 2023-12-19
J Ethnopharmacol:综合代谢组学和转录组学分析,揭示苍术油对脾阳虚证大鼠的影响
结合代谢组学和转录组学分析,揭示苍术油对脾阳虚证大鼠的改善作用及其机制。
MedSci原创 - 肝脏,代谢组学,转录组学,AMPK/SIRT1/PGC-1α,苍术油,脾阳虚证 - 2023-09-26
Circulation:血浆蛋白质组学联合单细胞转录组学“排序”心梗后心衰标志物
心力衰竭(HF)是急性心肌梗死(MI)的最常见的远期并发症。了解与MI后HF相关的血浆蛋白及其基因表达可能会为发现生物标志物和药物靶标确定新的候选对象。
MedSci原创 - 心肌梗死,心力衰竭,蛋白质组学,生物标志物,单细胞转录组学 - 2020-10-15
Science:利用空间转录组学技术可视化观察组织中的基因表达
在一项新的研究中,来自瑞典卡罗琳斯卡研究所和皇家理工学院等机构的研究人员开发出一种新的被称作空间转录组学(spatial transcriptomics)的高分辨率方法研究一种组织中哪些基因是有活性的
生物谷 Bioon.co - 转化医学,转录,RNA - 2016-07-04
Br J Cancer:基于血液转录组学特征的胃癌无创诊断策略研究
胃癌(GC)作为全球癌症相关死亡的第二大原因,在美国,几乎三分之一的GC患者在确诊时已为远端转移的晚期阶段,这些患者的5年生存率低于30%。
MedSci原创 - 胃癌,无创诊断,血液转录组学,5基因生物标志物评估系统 - 2021-06-28
基于英国“10万人基因组计划”转录组数据,揭示RNA-seq对罕见疾病的诊断潜力
该研究对英国“十万人基因组计划”(UK100K)中一个大型患者队列的转录组数据进行了初步分析,揭示了RNA-seq在改善罕见疾病诊断方面的潜力。
测序中国 - RNA-Seq,RNA测序,罕见疾病 - 2023-06-28
笔记收藏:影像组学/放射组学
近期在不同的学术会议上,有幸聆听学习了几位影像组学的大咖做报告,受益匪浅。以大咖们的报告为指导,自己也学习查找了一些文献,加入了一点点自己的理解和想法,整理成一篇笔记,与大家分享。名词解释:影像组学(Radiomics) “影像组学”,一共4个字,每个字都是常见字啊。但4个字放一起啥意思?好吧,我们把它们拆成“影像”和“组学”两个词来说。这里的“影像”通常指的就是放
MedSci原创 - 影像组学,放射组学 - 2018-07-25
Nature:空间转录组学开辟记忆编码新视角:长期恐惧记忆的分子地图
研究员通过高分辨率的空间和单细胞转录组学分析,研究者能够在分子和细胞层面上阐明BLA在长期记忆中的作用。
生物探索 - 长期记忆,BLA,空间转录组学 - 2024-02-13
A&R:尿液蛋白质组学和肾脏单细胞转录组学提示白细胞介素16在狼疮肾炎中的作用
与没有系统性红斑狼疮的对照组相比,该研究确定了237个与狼疮性肾炎相关的尿液生物标志物。白细胞介素16 (IL-16)、CD163和转化生长因子β反映了肾内肾炎的活性。
MedSci原创 - 肾脏,蛋白质组学,狼疮肾炎,尿液,资讯,单细胞组学,白细胞介素16 - 2022-05-19
Nature:基因组和转录组学揭示乳腺癌的新的10个亚组分类法
4月18日,Nature杂志发表了乳腺癌的一张“新地图”,确认了10个不同的疾病亚型,是基于基因活性进行确认的,这张新地图将会彻底改变乳腺癌的诊断和治疗。该结果来自于全球最大的乳腺癌基因分析课题。 这项研究意义非凡,著名的乳腺癌专家Martine Piccart教授讲到,目前乳腺癌的分类分型过于简单,使得我们在选择病人的治疗上无法达到最优。我一点都不感到惊讶,乳腺癌不止4种分型,而至少有10种亚
生物谷 - 肿瘤,癌症,乳腺癌 - 2012-04-20
Nat Neurosci: fMOST助力构建全球单细胞投射组学数据库
单细胞投射组学结果表明这些投射神经元具有64个亚型(IT具有44个亚型,PT具有12个亚型,CT具有8个亚型)。
“神经周K”公众号 - fMOST,单细胞投射 - 2022-09-14
单细胞转录组研究进展
单细胞转录组分析以单个细胞为特定研究对象,提取mRNA进行逆转录、放大和高通量测序分析,能揭示该细 胞内整体水平的基因表达状态和基因结构信息,准确反映细胞间的异质性,深入理解其基因型和表型之间的相互关系,在发育生物学、基础医学、临床诊断和药物开 发等领域都发挥重要作用.本文主要介绍了单细胞转录组分析的特点和技术发展历史以及常用研究策略和不同技术的优缺点,并就其面临挑战
生物化学与生物物理学进展 - 转录组,单细胞转录组 - 2014-01-03
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