Nat Biotechnol:单细胞和空间转录组的高分辨率比对方法CytoSPACE,可重建复杂组织
CytoSPACE是一个通过全局优化来分析单细胞和空间转录组的工具。与其他方法不同,CytoSPACE确保全局最优的单细胞比对。
测序中国 - 空间转录组,CytoSPACE - 2023-03-29
Nature | 单细胞分辨率绘制食蟹猴胚胎综合转录组图谱,揭示原肠胚形成和早期器官发生
该研究揭示了主要的泌乳周细胞类型的转录组特征,有助于阐明灵长类动物的形态发生事件。
测序中国 - 转录组图谱,单细胞分辨率,胚胎综合 - 2023-01-05
Nat Methods:谢晓亮课题组开发单细胞联合三维基因组和转录组测序技术解析嗅觉受体选择机制
该工作为理解嗅觉受体增强子与嗅觉受体基因的空间互作如何动态协调“一个神经元,一个受体”选择过程提供了宝贵见解。
测序中国 - 嗅觉受体,三维基因组 - 2024-04-23
空间转录组学方法EEL FISH:可实现高复用、高空间通量和高分辨的原位单细胞分析
大脑是一个高度结构化的器官,包含多种细胞类型,具有复杂的空间模式组织。目前研究分析这些不同细胞类型之间的组织和空间关系仍具有挑战性。
测序中国 - 空间转录组学方法,高空间通量,高分辨的原位单细胞分析 - 2022-11-13
BMC Genomics:基于单细胞和微阵列转录组整合分析的肺动脉高压患者枢纽基因的鉴定
深入了解PAH的分子机制至关重要,特别是在单细胞水平上的解析,以揭示潜在的治疗靶点和新的治疗策略。
MedSci原创 - 肺动脉高压,单细胞 - 2023-12-22
Science:新型单细胞基因组线性扩增法
谢晓亮教授在4月14日的Science上发表文章报道了实验室的最新研究:一种新型的单细胞基因组线性扩增的方法——转座插入(LIANTI,Linear Amplification with Transposon
生物探索 - 单细胞扩增 - 2017-04-17
STTT:袁勇/赵屹/廖奇团队基于单细胞转录组测序揭示食管鳞癌新辅助治疗耐受新机制
研究团队全面详细地刻画了食管鳞癌新辅助治疗耐受的肿瘤细胞群体特征及其分子机制,为精准治疗提供了潜在的靶点和方案。
测序中国 - 食管鳞癌,单细胞转录组测序 - 2023-08-25
Cell子刊:基于单细胞转录组测序数据,揭示胃腺癌进展过程中免疫、基质细胞状态及生态型演变
研究团队对癌前病变、局部和转移性GAC进行了单细胞分析,表征了GAC不同阶段TME中不同的免疫和基质细胞群,包括转录状态、细胞组成、分化轨迹、细胞间相互作用以及细胞生态类型。
测序中国 - 胃腺癌 - 2023-07-24
Theranostics:单细胞转录组学的重新分析揭示了巨噬细胞样平滑肌细胞在晚期动脉粥样硬化斑块中的关键作用
通过单细胞转录组学分析揭示了动脉粥样硬化斑块中不同功能SMC亚型的存在,并发现了潜在的干扰素调节因子-8(IRF8)通过激活核因子-κB(NF-κB)信号通路促进SMC向单核细胞转分化的机制。
MedSci原创 - 动脉粥样硬化,单核巨噬细胞 - 2024-02-26
Blood:单细胞测序揭示驱动HSC体外生成的转录因子和分子通路
一直以来,造血干细胞体外扩增都是一个难以克服的挑战,Fidanza等通过单细胞测序发现了参与HSC体外生成的转录因子和分子通路,是否有助于解决HSC体外难以有效扩增的困境?
MedSci原创 - 单细胞RNA测序,造血干细胞和祖细胞,单细胞蛋白质表达分析 - 2020-07-14
Eur Urol Focus:单细胞转录组学揭示骨髓细胞和T淋巴细胞在佩罗尼氏病纤维化微环境中的新作用
尽管有人认为PD的病理生理学中有免疫机制,目前为止还没有研究人员用单细胞转录组来调查这些免疫机制。
MedSci原创 - 阴茎,佩罗尼氏病,单细胞转录 - 2021-05-27
Blood:单细胞RNA-seq可揭示非整倍体造血细胞的特异性转录本。
癌细胞常发生染色体异常。特定的细胞遗传变异常可用于预测结局,特别是对于血液肿瘤,例如常发生于恶性髓性血液病的7号染色体的单倍体。一直以来,由于缺乏将非整倍体细胞与二倍体细胞区分的标志物,很难在细胞水平研究非整倍体对功能的影响。
MedSci原创 - 单细胞RNA-seq,造血细胞,单倍体 - 2017-10-15
MALBAC单细胞全基因组测序详细解析
单细胞全基因组测序一直是生物学家梦想得到的结果。但是其中必须解决的矛盾:1. 线性扩增。如果用全基因组PCR扩增,因为PCR的扩增偏向性(bias),再加上PCR过程中较小的偏向性通过指数放大,其结果就会是严重的覆盖不均一,导致在许多地方只有很低的覆盖、甚至没有覆盖。全基因组覆盖。常规的建库方法,因为补平、加A、接头连接效率的问题,
陈巍学基因 - 单细胞测序,全基因组 - 2014-04-06
2018单细胞组学技术与应用研讨会
近年来,单细胞组学领域发展得非常迅速,为人们研究肿瘤异质性以及微生物群落的生态多样性提供了新的视角。我国科学家也先后在顶级期刊发表诸多单细胞组学研究成果, 如北大谢晓亮团队开发的单细胞基因组线性扩增的方法—LIANTI,MALBAC® (Multiple Annealing and Looping Based
MedSci原创 - 单细胞 - 2018-09-14
Cell:单细胞全基因组高精彩度测序技术
日前,《细胞》(Cell)杂志上分别报道了来自中国学者的两项最新研究成果。复旦大学的徐彦辉等人首次破解 TET2 -DNA复合物的晶体结构;而来自北京大学的乔杰、汤富酬和谢晓亮等人则发布了突破性单细胞基因组检测技术。
生物360 - Cell,单细胞,全基因组,测序 - 2013-12-25
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