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Genome Res：西奈山伊坎医学院张斌团队发现超4700个基因簇对32种癌症的预后至关重要
通过结合基因组、转录组学和表观基因组学数据，研究团队分析了癌症基因组图谱队列中的所有32种主要癌症类型，全面表征了癌症中的共表达网络，确定了在调控癌症进展中起重要作用的4749个关键预后模块。
新发现：4749个基因对32种癌症预后具有深远影响，我们能做什么？
最近有个研究发现人体的4749个基因和32种癌症是相关的，癌度给大家编译一下，希望为大家在基因层面提供一些信息。
Genome Research：陈河兵/李程合作团队发表基于机器学习的单细胞年龄预测方法SCALE
该研究利用基因表达调控在衰老过程中的变化，构建了一种基于单细胞转录组数据的生物学年龄估计模型（Single-cell aging-level estimator, SCALE）。
Genome Res：变分图卷积自编码器框架——PAST，可融合外部参考数据进行空间转录组数据降维分析
该模型不仅可以有效提取空间转录组数据的低维表示特征，辨识空间功能区域（Spatial Domains），还能够促进数据可视化、发育轨迹推断和伪时序分析等多种下游任务。
Genome Res：四川大学姚少华团队开发一种新型先导编辑方案实现精确基因组扩增
该研究还通过精细调节TD-PE，制备了多种与疾病相关的串联重复扩增，展示了其在遗传学研究中应用潜力。
Genome Res ：你的胖和男朋友的胖其实不一样，面临的健康风险也不同
虽然都是胖，但男女储存脂肪的部位是不一样的，男性多余的脂肪更容易储存在腹部，而女性在绝经前，脂肪多储存在臀部、大腿和髋部，而引起这种差别的原因很大程度上是基于肥胖基因的性别差异。
Genome Res：改良版基因编辑技术，竟然是控制肥胖和糖尿病的“神器”？
根据世界卫生组织（WHO）的数据，2016年全球超过19亿成年人超重，其中超过6.5亿人患有肥胖症。超重或肥胖会增加患糖尿病、心脏病、某些类型的癌症和肌肉骨骼问题，尤其是骨关节炎。
Genome Res：长读长测序—揭示乳腺癌中的大规模基因组破坏
大约20％的乳腺癌是“HER2阳性”，它们会产生过量HER2蛋白，往往是最具攻击性的癌症之一。癌症做到早发现需要尽早准确的发现基因周围高度复杂的DNA变异。研究人员认为长读序列是捕获结构变异复杂性的宝贵工具，这对进一步研究和临床应用有着重要意义。
Genome Res：明晰癌症DNA修复缺陷的起源
尽管癌症突变和DNA修复机制之间的联系已经被很好地建立，但这些基本途径中突变的具体来源仍然是个谜。最近，欧洲生物信息学研究所( EMBL-EBI )、英国Dundee大学和Wellcome Sanger研究所的研究人员利用人类和线虫数据探索了癌症突变的原因。
Genome Res：“超级细菌”揭示大肠杆菌血液感染的复杂情况
对大肠杆菌(E.coli)的首次大规模遗传学研究表明，耐药“超级细菌”并不总是与其他菌株竞争，大肠杆菌来自英国血液感染患者。 Wellcome Trust Sanger研究所及其合作者的研究表明，新型大肠杆菌经常出现，但与其他一些感染不同，耐药菌株并不是感染的主要原因。
Genome Res：新发现！癌症原来是这样转移的
2017年5月9日国际专业基因组学研究刊物Genome Research在线发表了北京大学白凡、谢晓亮团队与天津医科大学张宁团队合作研究成果。作者团队使用单细胞测序技术对来自同一病人的循环肿瘤细胞和单个原发灶癌细胞的拷贝数变异进行分析，揭示了在肿瘤转移过程中基因拷贝数变异的演化过程。作者团队进一步对来自结直肠癌、乳腺癌、胃癌、前列腺癌多个癌种的病人外周血循环肿瘤细胞进行分析，研究了不同癌种的循环肿
Genome Res：揭开黑匣子，“胚胎嵌合体”的更多秘密
导读 卵子受精及受精卵依附在子宫内壁的那一刻会发生什么，人们对此知之甚少，这也成为了发育生物学的黑匣子。《Genome Research》杂志第五期报道了一种意想不到的现象——胚胎中有些细胞的基因组全来自父本，而有些细胞的基因组全来自母本。
Genome Res：研究首次揭示“跳跃基因”引发结直肠癌的机制
Genome Res：研究首次揭示“跳跃基因”引发结直肠癌的机制来自马里兰大学医学院的一项新的研究首次揭示了跳跃基因引发结直肠癌的发病机制，该研究成果已发表于Genome Research。20世纪40年代科学家们就已经了解了“跳跃基因”——从染色体的一个部位移动到另一个部位的DNA片段。在那十年里，遗传学家和诺贝尔奖得主Barbara McClintock在研究玉米植株时发现了跳跃基因。最近，科
Genome Res：通过检测突变基因，有望诊断早期散发性乳腺癌患者
研究人员发现了乳腺细胞出现的一种基因改变,这意味着散发性乳腺癌发病率或许有增高的风险。这种基因改变可以帮助医生尽早确立早期乳腺癌的诊断，减轻患者的痛苦，并提高其生存周期。 这项发表在Genome Research的研究由来自瑞典、波兰和美国的研究人员共同参与，瑞典乌普萨拉大学免疫学、遗传学和病理学教授Jan Dumanski领导进行。 “这项研究有望探究出新的评估检测方法，以便能耐及时筛选出具有乳
斑马鱼——CRISPR高通量基因功能研究新平台
近日，来自美国NIH的研究人员进行了一项研究，他们利用CRISPR-CAS9技术靶向斑马鱼特定DNA序列进行基因功能探索和人类治病基因的发现研究，相关研究成果在线发表在国际学术期刊genome research。 在这项研究中，研究人员发现利用基因编辑技术CRISPR-CAS9进行斑马鱼基因靶向识别以及插入删除特定基因的效率可以达到其他技术的6倍。同时，利用CRISPR-CAS9
Genome Res：重磅喜讯：全基因组测序助力准父母订制双胞胎！
一个科学家研究小组开发出一种新型的全基因组测序方法： 可用来检测体外受精（IVF）的胚胎是否发生了突变 随着女性生殖年龄的推迟及环境等因素，许多育龄夫妇虽然很想要孩子，但是由于身体的原因一直不能如愿。随着生物科学和医学研究的发展，对于这样的夫妇来说，终于有补救措施了——他们可以寄希望于试管婴儿技术，生育可爱的宝宝！自1978年世界首例试管婴儿（IVF婴儿）降临后，迄今已经有500多万的
Genome Res：全基因组测序追踪耐药细菌传播机制
耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）是一种常见的引发院内感染的致病菌，其也是资源不足医院感染的一大负担，此前当资源较好的临床机构运用全基因组测序来追踪MRSA的扩散时，针对有限的感染控制的传播动力学常常并不清楚，近日，来自剑桥大学的研究人员就利用全基因组测序的技术揭示了高传播率的资源受限医院中MRSA的扩散，相关研究发表于国际杂志Genome Research上。 研究者对来自泰国东北部的一
Genome Res：RNA测序技术发现胶质瘤新的分子分型特征
生命科学学院生物动态光学成像中心（BIOPIC）苏晓东研究组和北京天坛医院江涛研究组以及加州大学圣地亚哥分校的Clark Chen研究组合作在《Genome Research》杂志在线发表了题为“RNA-seq of 272 gliomas revealed a novel, recurrent PTPRZ1-MET fusion transcript in secondary gliobl
