JCLA：如何尽量减少来自基因组DNA的cfDNA污染？
2019-06-06 不详 网络
众所周知，靶cfDNA在全血浆中的比例较低。由于操作不当导致的血细胞裂解所产生的丰富的gDNA背景已成为准确测定cfDNA的主要障碍。在本研究中，我们研究了三种血细胞收集管(BCTs)在预防白细胞破裂引起的基因组DNA污染方面的能力，并结合高灵敏度突变检测技术对其性能进行了评估。 本研究血液样本取自6名健康献血者，并存储在三种类型的BCTs中(BD K2‐EDTA管、Roche管和Strec
众所周知，靶cfDNA在全血浆中的比例较低。由于操作不当导致的血细胞裂解所产生的丰富的gDNA背景已成为准确测定cfDNA的主要障碍。在本研究中，我们研究了三种血细胞收集管(BCTs)在预防白细胞破裂引起的基因组DNA污染方面的能力，并结合高灵敏度突变检测技术对其性能进行了评估。
本研究血液样本取自6名健康献血者，并存储在三种类型的BCTs中(BD K2‐EDTA管、Roche管和Streck管)。在特定时间点(第0天、第3天、第7天和第14天)分离血浆样品进行含量分析。
与BD K2‐EDTA管和Streck管相比，罗氏BCT在14天内预防由白细胞分裂引起的cfDNA污染方面表现出更好。BD管出现严重的白细胞溶解和gDNA污染。罗氏管和Streck管对下一代测序(NGS)文库数量和复杂度的影响在3天内没有显著差异，这满足了我们的大部分日常需求。此外，WBC破裂与BCTs溶血不同步。
本研究表明，采血管在保存血样方面存在较大差异。因此，应选择合适的采血设备，尽量减少gDNA污染，规范血样处理，使cfDNA的临床分析更加准确可靠。
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