AASLD 2023：这7个新型基因可预测非酒精性脂肪性肝病合并肝纤维化进展为肝细胞癌的风险

一年一度的美国肝病研究学会年会（AASLD2023）于美国波士顿拉开帷幕。经过几十年的发展，AASLD已经成长为有关肝病各个方便研究的国际性组织。该协会的年会是目前世界上最大的、聚集肝脏病学家最多的会议，本次会议将汇集世界各地超过9500名肝病学家和从事肝病研究的专业人士参加，交流肝病学领域的突破性研究成果，以及新的治疗指南以及最新的治疗进展。

非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）是世界范围内最常见的慢性肝病，包括非酒精性脂肪变性、非酒精性脂肪性肝炎、肝纤维化和肝硬化。越来越多的证据显示，NAFLD是肝细胞癌（HCC）的重要危险因素，而肝纤维化是HCC的一个关键阶段。目前，尽管临床检查对NAFLD及其各个阶段的诊断提供了有效的帮助，但并不能预测NAFLD合并肝纤维化进展为HCC的可能性。因此，有必要挖掘相关生物标志物来完善这一不足。

在此次年会上，研究人员发表了一项新研究，旨在筛选出预测NAFLD进展为HCC的分子标志物。研究人员通过下载了GEO数据库中NAFLD合并纤维化和NAFLD相关HCC的RNA-seq数据来鉴定差异表达基因。为了探索差异表达基因的潜在功能和风险预测的关键基因，并对两组差异表达基因的交集基因进行了GO和KEGG富集分析以及蛋白相互作用分析，同时鉴定出预测NAFLD发展为HCC风险的关键基因。随后，确定最适合预测NAFLD合并肝纤维化进展为HCC的基因模型。此外，为了评估基因模型的性能，研究人员利用两组肝脏组织测序数据进行了验证，第一组包含NAFLD合并肝纤维化和NAFLD相关HCC的测序数据，第二组包含NAFLD合并肝纤维化和NASH相关HCC的测序数据。利用ROC曲线评估基因模型性能。

结果显示，在NAFLD合并肝脏纤维化的数据集中鉴定出559个差异表达基因，在NAFLD相关 HCC的数据集中鉴定出2164个差异表达基因，共88个交叉基因。交叉基因与活性氧应答、应激激活的MAPK级联反应、凋亡信号通路和IL-17信号通路的正调控密切相关。蛋白相互作用网络将7个基因鉴定为关键基因，包括TIPM1、COL1A1、CXCL9、FOS、VWF、CD79A和VCAN，并利用7个关键基因构建基因模型。

NAFLD相关HCC数据集用于风险预测的ROC曲线下面积（AUC）为0.893，NASH相关HCC数据集用于风险预测的AUC为0.751。在TCGA数据集中，用于风险预测的AUC为0.572，HCC高危组的总生存期明显短于低危组。GSEA集富集分析显示PPAR信号通路、胰岛素信号通路和脂肪酸代谢在高危组显著上调，细胞内的凋亡信号通路负调控在低危组显著上调。肿瘤免疫浸润分析分析显示，高危组CXCL9与巨噬细胞M1呈显著正相关，VCAN与巨噬细胞M2呈显著负相关。

综上，这项研究通过生物信息研究方法，鉴定出TIPM1、COL1A1、CXCL9、FOS、VWF、CD79A和VCAN7个新型基因也可能在介导NAFLD发展为HCC的潜在分子机制中发挥关键作用。

参考资料

Identification of Novel Hub Genes that may Predict the Risk of Liver Fibrosis Progressing to Hepatocellular Carcinoma In Non-Alcoholic Fatty Liver Disease.https://www.aasld.org/the-liver-meeting