Nature子刊：中国药科大学郝海平/叶慧团队绘制癌细胞中糖酵解靶标图谱
2023-06-19 生物世界 生物世界 发表于上海
该研究使用一种新的靶标发现方法——靶标响应可及性变化谱（TRAP）技术确定了癌细胞中糖酵解代谢物的全面靶标组。
过度活跃的糖酵解是大多数癌细胞的代谢特征。尽管零星的信息表明糖酵解代谢物具有作为信号分子的非代谢功能，但这些代谢物如何与它们的结合靶点相互作用并在功能上调节它们的结合靶点，仍是一个谜。
2023年6月15日，中国药科大学郝海平/叶慧团队在 Nature 子刊 Nature Chemical Biology 上发表了题为：Chemoproteomic mapping of the glycolytic targetome in cancer cells 的研究论文。
该研究使用一种新的靶标发现方法——靶标响应可及性变化谱（TRAP）技术确定了癌细胞中糖酵解代谢物的全面靶标组。靶标组揭示了糖酵解代谢物的多种调控模式，包括与代谢酶结合、影响转录输出和调控翻译后修饰水平，从而阐明了糖酵解代谢物如何作为信号分子发挥作用。
这些结果进一步加深了我们对糖酵解如何协调癌细胞中的信号通路以支持其生存的认识，并激发了糖酵解靶标组用于癌症治疗靶点的开发。
该研究聚焦于大多数癌细胞中过度活跃的糖酵解通路。基于前期多个重磅研究揭示出糖酵解通路上部分代谢物可以作为信号分子发挥非代谢的功能，研究团队提出通过描绘糖酵解通路上主要代谢物的靶标组，全面理解糖酵解支撑肿瘤发生发展的机制。
为了高通量描绘多个代谢物的靶标，郝海平/叶慧团队在现有靶标发现技术体系中寻求创新，建立了靶标响应可及性变化谱TRAP技术（Target-Responsive Accessibility Profiling）。TRAP通过标记全蛋白组水平赖氨酸来表征蛋白的溶剂可及性，再通过比较配体结合前后蛋白可及性的变化，鉴定靶标及配体结合区域；具有互补于现有靶标发现方法的技术优势。
利用TRAP技术，研究团队在模型癌细胞系中共描绘了10种糖酵解代谢物的靶标组，共发现913个可及性变化的候选靶标。进一步的机制研究揭示了糖酵解代谢物对靶标组的丰富调控模式，包含干扰碳代谢酶的活性、影响转录蛋白的功能及靶标的翻译后修饰水平等。
上述结果确证了癌细胞中糖酵解代谢物除了参与代谢层面的活动以外，还作为信号分子发挥全局调控功能，为后续基于糖酵解代谢物的靶标组挖掘癌症治疗靶点提供了重要的线索与数据资源。
论文链接：
https://www.nature.com/articles/s41589-023-01355-w
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