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Genome Biol:席瑞斌团队发表肿瘤新抗原预测算法NeoSV,泛癌分析揭示<font color="red">SV</font>为肿瘤新抗原重要来源

Genome Biol:席瑞斌团队发表肿瘤新抗原预测算法NeoSV,泛癌分析揭示SV为肿瘤新抗原重要来源

该研究证明了基因突变相关的新抗原负荷,能够比肿瘤新抗原负荷更好地描述肿瘤与免疫的相互作用,并可能改善患者对免疫治疗的选择。

测序中国 - 泛癌分析,NeoSV - 2023-08-11

NBT:叶凯团队开发基于“序列-图像”转换的差异比较算法SVision-pro,实现高精确性<font color="red">SV</font>检测及分型

NBT:叶凯团队开发基于“序列-图像”转换的差异比较算法SVision-pro,实现高精确性SV检测及分型

叶凯教授团队开发了SVision-pro,这是一种基于神经网络的实例分割框架,能够直观地表示基因组到基因组水平的测序差异,并在无需任何推断模型的条件下比较地发现基因组之间的SV

测序中国 - 测序,SVision-pro,SV检测 - 2024-04-16

WGS数据分析全面表征不同儿童脑肿瘤类型体细胞<font color="red">SV</font>特征

WGS数据分析全面表征不同儿童脑肿瘤类型体细胞SV特征

研究团队分析了PBTA中744个儿童脑肿瘤样本的全基因组序列,共检测到13,199个高置信度的体细胞SV;进一步分解简单和复杂SV特征以推断其突变机制,发现不同肿瘤类型的SV特征存在巨大的异质性。

测序中国 - 脑癌,儿童脑肿瘤,结构变异,全基因组序列 - 2023-11-19

Luu教授团队揭示<font color="red">SV</font>40大T抗原诱导的永生化使小鼠心肌祖细胞具有间充质干细胞特性和成骨潜能

Luu教授团队揭示SV40大T抗原诱导的永生化使小鼠心肌祖细胞具有间充质干细胞特性和成骨潜能

本研究表明,CRE重组酶可逆转SV40 LTA诱导的小鼠E15.5胎儿心脏CPs永生化,通过SV40 LTA诱导的细胞永生化,小鼠心肌祖细胞具有间充质干细胞特性。

Genes and Diseases - SV40,心肌祖细胞 - 2024-03-11

Sci Rep:在C57BL/6 and 129S1/<font color="red">Sv</font>小鼠中,Cdh23单核苷酸替换对年龄相关听力损失的影响和同类系的比较

Sci Rep:在C57BL/6 and 129S1/Sv小鼠中,Cdh23单核苷酸替换对年龄相关听力损失的影响和同类系的比较

钙黏蛋白23基因(Cdh23c.753A)的单个核苷酸多态性(SNV)在许多同系交配的小鼠种系普遍存在,并且可以促进年龄相关的听力损失(AHL)和恶化其他突变体的听觉表型。最近,研究人员在C57BL/6NJ (B6N) 和 129S1/SvImJ (129S1)胚胎干细胞中利用同源重组来产生相对的单碱基对替代小鼠种系(B6-Cdh23c.753A>G 和129S1-Cdh23c.753G&g

MedSci原创 - 听力损失,单核苷酸多态性,同类系 - 2017-03-27

JACC:沙库比曲缬沙坦 vs ACEI/ARB使用患者血管性水肿的发生率

JACC:沙库比曲缬沙坦 vs ACEI/ARB使用患者血管性水肿的发生率

与沙库比曲缬沙坦新使用者相比,如果患者近期内将ACE抑制剂或ARB换为沙库比曲缬沙坦则发生血管性水肿的风险会大大增加

MedSci原创 - ACE抑制剂,血管性水肿,沙库比曲缬沙坦 - 2023-01-31

Nat Commun:利用图形泛基因组图谱可灵敏识别罕见遗传病的结构变异,并降低错误率

Nat Commun:利用图形泛基因组图谱可灵敏识别罕见遗传病的结构变异,并降低错误率

研究团队探讨了在罕见病队列中使用图形泛基因组来表征SV的益处;利用标准参考基因组、公共组装以及罕见疾病项目中大量的长读长、高保真度基因组测序数据。

测序中国 - 基因组图谱,图形泛基因组,基因组测序 - 2024-03-09

全基因组重测序数据,十种主要分析方法全面介绍

全基因组重测序数据,十种主要分析方法全面介绍

通过高通量测序识别发现de novo的somatic和germ line 突变,结构变异-SNV,包括重排突变(deletioin, duplication 以及copy number variation)以及SNP的座位;针对重排突变和SNP的功能性进行综合分析;我们将分析基因功能(包括miRNA),重组率(Recombination)情况,杂合性缺失(LOH)以及进化选择与mutation

MedSci原创 - 全基因组,测序 - 2016-06-16

梅举:微创左胸小切口多支冠脉搭桥术

梅举:微创左胸小切口多支冠脉搭桥术

冠状动脉旁路移植术(Coronary Artery Bypass Graft, CABG)常规使用胸腹正中切口,而这一方法创伤大,术后伤口较大,恢复慢且易产生并发症。

门诊新视野 - 动脉粥样硬化,冠状动脉旁路移植术,胸心外科 - 2020-12-31

European Radiology:比较CT容积法和肝动态CT对肝癌患者肝纤维化的预测能力

European Radiology:比较CT容积法和肝动态CT对肝癌患者肝纤维化的预测能力

现阶段,CT容积分析(CTV)和细胞外容积分数(ECV)是诊断脏纤维化(LF)的高度敏感和特异的工具。

MedSci原创 - 肝癌,肝纤维化 - 2022-11-06

Nat Commun:基于12种癌症类型的多组学数据分析,揭示体细胞结构变异对癌症蛋白质组的影响

Nat Commun:基于12种癌症类型的多组学数据分析,揭示体细胞结构变异对癌症蛋白质组的影响

研究团队将基于MS的蛋白质组学数据与跨不同癌症类型的WGS、多组学数据相结合,以确定体细胞SV断点模式对附近基因蛋白表达的影响。

测序中国 - 癌症蛋白质组,多组学数据分析 - 2023-10-06

JACC:心超技术员在心脏介入手术中暴露的辐射剂量问题不容忽视!

JACC:心超技术员在心脏介入手术中暴露的辐射剂量问题不容忽视!

经食道超声技术员(TEEOP)可以为心脏介入手术患者提供必要的临床影像资料,他们的位置往往靠近患者,并且会收到一些散在的辐射。本研究的目的旨在评估TEEOP在心脏介入手术中收到的辐射剂量。本研究对关键相关人员(TEEOP、麻醉师、主刀和二助)在做经食道超声检查时佩戴可卸载的辐射检测仪,对TEEOP的有效剂量(E)和E/KAP进行了测量。分析结构发现,在最开始的98次操作中,TEEOP的平均E值为2

MedSci原创 - 心血管,介入,心超 - 2018-03-18

Eur Radiol:别再说你没出去鬼混了,拉去做个MRI没准就能看出来!--射精后前列腺和精囊T2值的变化

Eur Radiol:别再说你没出去鬼混了,拉去做个MRI没准就能看出来!--射精后前列腺和精囊T2值的变化

该研究旨在利用MRI评价射精后前列腺和精囊(SV)T2值的变化,并将结果发表在Eur Radiol上。

MedSci原创 - 射精,前列腺,精囊 - 2017-11-01

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