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Cell：利用<font color="red">蛋白质</font>-<font color="red">基因组</font><font color="red">学</font>描述人高分级浆液性卵巢<font color="red">癌</font>

Cell：利用蛋白质-基因组学描述人高分级浆液性卵巢癌

在一项新的研究中，来自美国西北太平洋国家实验室（PNNL）和约翰霍普金斯大学（JHU）等机构的研究人员研究了169名卵巢癌患者的肿瘤蛋白质组以便鉴定她们所患肿瘤中存在的关键性蛋白。通过将这些卵巢癌蛋白质组方面的发现与已知的这些肿瘤的基因组数据整合在一起，研究人员报道了对最为恶性的卵巢癌---浆液性卵巢癌（serous ovarian cancer）---的潜在新认识。

生物谷 - 蛋白质，蛋白质，卵巢癌 - 2016-07-03

<font color="red">泛</font><font color="red">癌</font><font color="red">蛋白质</font><font color="red">基因组</font>学分析揭示致癌驱动因素与功能状态的关联

泛癌蛋白质基因组学分析揭示致癌驱动因素与功能状态的关联

该研究扩展了之前以基因组学为中心的泛癌研究，通过识别在RNA、蛋白质和磷蛋白水平上量化的显著顺式效应和远端反式效应，在多个维度揭示了癌症驱动因子的影响。

测序中国 - 癌症，泛癌蛋白质基因组学 - 2023-08-29

Cancer Cell：基于上千例<font color="red">泛</font><font color="red">癌</font>多组<font color="red">学</font>数据，CPTAC发布<font color="red">蛋白</font><font color="red">基因组</font><font color="red">学</font>共享数据资源

Cancer Cell：基于上千例泛癌多组学数据，CPTAC发布蛋白基因组学共享数据资源

该文章概述了CPTAC泛癌研究团队在数据协调、数据传播和帮助生物发现的计算资源方面所做出的努力，并讨论了多组学数据整合和分析的挑战。

测序中国 - 泛癌多组学，蛋白基因组学 - 2023-08-30

PNAS：癌症和邻近正常组织中具有重复不稳定的<font color="red">蛋白质</font><font color="red">组</font><font color="red">学</font>和<font color="red">基因组</font><font color="red">学</font>特征

PNAS：癌症和邻近正常组织中具有重复不稳定的蛋白质组学和基因组学特征

已有的研究显示，重复序列是多个层次的进化热点。然而，由于其装配和分析中涉及的困难，现今，我们关于重复序列在肿瘤进化中的作用还知之甚少。

MedSci原创 - 肿瘤，基因组 - 2019-08-09

Cell | 肾透明细胞<font color="red">癌</font>的整合<font color="red">蛋白</font><font color="red">基因组</font><font color="red">学</font>研究

Cell | 肾透明细胞癌的整合蛋白基因组学研究

肾细胞癌是世界十大常见的癌症之一，其中75%为肾透明细胞癌（clear cell renal cell carcinoma，ccRCC）并占据了肾细胞癌死亡的绝大部分。为了揭示ccRCC发生的分子机制，TCGA对基因组、表观遗传组、转录组进行分析，鉴定出包括多种抑癌基因缺失在内的ccRCC分子特征。研究显示VHL基因异常是一个普遍性起始事件，随后PBRM1、SETD2、KDM5C、BAP1等突变参

BioArt - 肾透明细胞癌，的整合蛋白基因组学研究 - 2019-11-02

BioNeMo模型扩展到<font color="red">基因组</font><font color="red">学</font>！英伟达推出生成式AI药物设计和<font color="red">蛋白质</font>预测项目

BioNeMo模型扩展到基因组学！英伟达推出生成式AI药物设计和蛋白质预测项目

英伟达计划将扩展后的BioNeMo模型作为一系列基于云的企业服务提供给客户，并通过AWS HealthOmics平台提供药物分子结合和蛋白质结构变化的预测指标。

测序中国 - BioNeMo模型，基因组学，AI药物设计，英伟达 - 2024-03-27

Cancer Cell：CPTAC发布<font color="red">蛋白</font><font color="red">基因组</font><font color="red">学</font>共享数据资源

Cancer Cell：CPTAC发布蛋白基因组学共享数据资源

基于上千例泛癌多组学数据，CPTAC发布蛋白基因组学共享数据资源

测序中国 - 泛癌多组学，蛋白基因组学 - 2023-09-02

Cell：综合<font color="red">泛</font><font color="red">癌</font><font color="red">蛋白</font><font color="red">基因组</font>学分析揭示跨越10种癌症类型的7种免疫亚型

Cell：综合泛癌蛋白基因组学分析揭示跨越10种癌症类型的7种免疫亚型

该研究使用临床蛋白质组肿瘤分析联合会（CPTAC）的泛癌蛋白质基因组数据集全面表征了来自10种癌症的1056个肿瘤样本的免疫图谱。

测序中国 - 泛癌蛋白质基因组，免疫亚型，癌症 - 2024-03-22

Genome Medicine：基于人血浆<font color="red">蛋白质</font><font color="red">组</font>与<font color="red">基因组</font>数据，鉴定新型CRC<font color="red">蛋白质</font>标志物及药物靶点

Genome Medicine：基于人血浆蛋白质组与基因组数据，鉴定新型CRC蛋白质标志物及药物靶点

研究团队对4,853种血浆蛋白与CRC风险之间的因果关联进行了全面研究；采用单细胞类型表达分析来检测结肠肿瘤组织中富集的细胞类型，并进行成药性评估，以探索其作为CRC治疗靶点的潜力。

测序中国 - 结直肠癌，CRC蛋白质标志物 - 2023-10-30

基于全<font color="red">基因组</font><font color="red">基因</font>型-血清<font color="red">蛋白质</font>组分析，首次揭示中国汉族人群血液<font color="red">蛋白质</font><font color="red">组</font>的遗传机制

基于全基因组基因型-血清蛋白质组分析，首次揭示中国汉族人群血液蛋白质组的遗传机制

循环蛋白作为生物标志物被广泛用于揭示新的药物靶点和临床结果的解释。蛋白质的遗传调控众所周知，但却鲜有描述，这不仅激发了商业上的兴趣，也激发了科学上的探索。

测序中国 - 循环蛋白，蛋白质水平 - 2023-03-14

J Periodontol：慢性牙周炎牙龈内的分子标记物：一项<font color="red">基因组</font>和<font color="red">蛋白质</font><font color="red">组</font><font color="red">学</font>的分析

J Periodontol：慢性牙周炎牙龈内的分子标记物：一项基因组和蛋白质组学的分析

这项研究的目的是通过整个基因组转录和蛋白质谱的组学分析评估罹患牙周炎(CP)牙龈组织样本的分子标记物。

MedSci原创 - Cp，标记物 - 2019-01-21

Cancer Cell | 基于949种人类癌细胞系绘制<font color="red">泛</font><font color="red">癌</font><font color="red">蛋白质</font><font color="red">组</font>图谱，揭示数千种癌症易感性<font color="red">蛋白质</font>生物标志物

Cancer Cell | 基于949种人类癌细胞系绘制泛癌蛋白质组图谱，揭示数千种癌症易感性蛋白质生物标志物

该图谱量化了949种人类癌细胞系中的8498种蛋白质，代表28种组织和40多种组织学上不同的癌症类型和广泛的基因型，显著扩展了癌症模型的分子特征。

测序中国 - 标志物，癌细胞系，蛋白质组图谱 - 2022-08-09

蛋白质基因组学：运用蛋白质组技术注释基因组

  随着高通量DNA测序技术的飞速发展，越来越多的物种完成了基因组测序．定位编码基因、确定编码基因结构是 基因组注释的基本任务，然而以往的基因组注释方法主要依赖于DNA及RNA序列信息．为了更加精确地解读完成测序的基因组，我们需要整合多种类型的组学数 据进行基因组注释．近年来，基于串联质谱技术的蛋白质组学已经发展成熟，实现了对蛋白质组的高覆盖，使得利用串联质谱数据进行基因组注释成为可

生物化学与生物物理学进展 - 亚硝基化谷胱甘肽还原酶，GSNOR，NO，炎症因子 - 2014-01-03

Nature：大规模乳腺癌“蛋白质基因组学”被揭示

基于来自癌症基因组图谱(TCGA)计划的数据，一个多机构科学家小组完成了首个大规模的乳腺癌“蛋白质基因组学”（proteogenomic）研究，将一些DNA突变与蛋白质信号联系到一起，并帮助确定了一些驱动癌症的基因这项研究旨在通过蛋白质和它们的修饰来更好地认识癌症。发表在5月25日《自然》（Nature）杂志上的研究论文，证实了相比于单独采用任一种分析方法，整合基因组和蛋白质组数据来生成更完

MedSci原创 - 乳腺癌，蛋白质基因组学 - 2016-05-28

PNAS：特殊蛋白质可控制机体“基因组卫士”

近日，发表在国际杂志PNAS上的一篇研究报告中，来自蒙特利尔临床研究学院的科学家通过研究鉴别出了免疫反应已知机制的一种新的作用亮点，研究人员发现了一种新型特殊蛋白，其可以控制“基因组卫士”—p53肿瘤抑制蛋白的活性

生物谷 - 蛋白质，基因组 - 2014-12-09

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