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SPATA:基因集驱动的<font color="red">空间</font><font color="red">转录</font>组分析框架

SPATA:基因集驱动的空间转录组分析框架

SPATA -

简书 - 生物信息学,空间转录组 - 2021-02-06

基于<font color="red">转录</font><font color="red">组</font><font color="red">学</font>和蛋白质<font color="red">组</font><font color="red">学</font>的高海拔肺动脉高压大鼠模型的新靶点

基于转录和蛋白质的高海拔肺动脉高压大鼠模型的新靶点

通过多组筛选,发现参与HAPH的关键基因。

MedSci原创 - 蛋白质组学,转录组学,高海拔肺动脉高压 - 2021-11-24

Nat Biotechnol:单细胞和<font color="red">空间</font><font color="red">转录</font><font color="red">组</font>的高分辨率比对方法CytoSPACE,可重建复杂组织

Nat Biotechnol:单细胞和空间转录的高分辨率比对方法CytoSPACE,可重建复杂组织

CytoSPACE是一个通过全局优化来分析单细胞和空间转录的工具。与其他方法不同,CytoSPACE确保全局最优的单细胞比对。

测序中国 - 空间转录组,CytoSPACE - 2023-03-29

Nature:RNA 修饰研究有助表观<font color="red">转录</font><font color="red">组</font><font color="red">学</font>进一步发展

Nature:RNA 修饰研究有助表观转录进一步发展

随着科研人员逐渐揭开 RNA 修饰的奥秘,帮助我们了解表观转录(epitranscriptomics)的工具也变得越来越多了。

生命奥秘/Eason - RNA修饰,转录组学 - 2017-03-21

Nat Genet:WES联合RNA-seq分析揭示晚期NSCLC免疫治疗的基因<font color="red">组</font><font color="red">学</font>和<font color="red">转录</font><font color="red">组</font><font color="red">学</font>特征

Nat Genet:WES联合RNA-seq分析揭示晚期NSCLC免疫治疗的基因转录特征

通过对基因特征以及已有的免疫和肿瘤生物相关特征的综合分析,发现了不同信号通路和不同细胞类型之间复杂相互作用的现象,进一步揭示了免疫检查点抑制剂治疗背后的多维度相互作用。

测序中国 - NSCLC免疫治疗 - 2023-05-06

NAR:深圳国家基因库/华大生命科学研究院发表<font color="red">空间</font><font color="red">转录</font><font color="red">组</font><font color="red">学</font>数据共享、分析和可视化综合数据库STOmicsDB

NAR:深圳国家基因库/华大生命科学研究院发表空间转录数据共享、分析和可视化综合数据库STOmicsDB

文章介绍了一站式空间转录数据库STOmicsDB,有助于空间转录领域的数据存档、共享、可视化和分析。

测序中国 - 空间转录组学,可视化综合数据库 - 2023-12-19

右心室对急性压力后负荷增加的时空<font color="red">转录</font><font color="red">组</font><font color="red">学</font>反应

右心室对急性压力后负荷增加的时空转录反应

利用降维来分析跨多个加载条件的整个时空空间。 这种方法使我们能够可视化 11 种相互比较的条件,并确定关键重塑通路的激活如何受到时间、机械应力和区域的影响。

MedSci原创 - 右心室,空转录组学,急性压力超负荷 - 2023-06-19

三种不同疾病引起肺动脉高压的<font color="red">转录</font><font color="red">组</font><font color="red">学</font>比较

三种不同疾病引起肺动脉高压的转录比较

肺动脉高压(PAH)的特征是与多种临床疾病相关的心血管疾病,导致肺血管阻力进行性增加并最终诱发右心衰竭。根据指南,PAH 因病因不同分为七类。众所周知,在各种相关疾病中,BMPR2等可遗传致病基因的突

MedSci原创 - 肺动脉高压,DNA损伤,细胞循环,基因通路 - 2021-10-08

Blood:慢性淋巴细胞白血病Richter转化的基因<font color="red">组</font>和<font color="red">转录</font><font color="red">组</font><font color="red">学</font>特征

Blood:慢性淋巴细胞白血病Richter转化的基因转录特征

慢性淋巴细胞白血病(CLL)向高级别B细胞淋巴瘤的转化被称为Richter综合征(RS),较为罕见,而且这类患者的预后较差。

MedSci原创 - 慢性淋巴细胞白血病(CLL),WGS,Richter转化 - 2020-12-25

European Radiology:联合放射<font color="red">组</font><font color="red">学</font>和<font color="red">转录</font><font color="red">组</font>学分析揭示了非小细胞肺癌的亚型特征

European Radiology:联合放射转录学分析揭示了非小细胞肺癌的亚型特征

一些优秀的放射基因研究发现,放射基因可以帮助预测NSCLC的突变状态。

MedSci原创 - 非小细胞肺癌,转录组学,放射组学 - 2023-05-13

Br J Cancer:基于血液<font color="red">转录</font><font color="red">组</font><font color="red">学</font>特征的胃癌无创诊断策略研究

Br J Cancer:基于血液转录特征的胃癌无创诊断策略研究

胃癌(GC)作为全球癌症相关死亡的第二大原因,在美国,几乎三分之一的GC患者在确诊时已为远端转移的晚期阶段,这些患者的5年生存率低于30%。

MedSci原创 - 胃癌,无创诊断,血液转录组学,5基因生物标志物评估系统 - 2021-06-28

Nat Neurosci:张毅等利用<font color="red">空间</font><font color="red">转录</font><font color="red">组</font>技术绘制小鼠前额叶皮层全新细胞图谱,并解析疼痛相关细胞

Nat Neurosci:张毅等利用空间转录技术绘制小鼠前额叶皮层全新细胞图谱,并解析疼痛相关细胞

使用MERFISH (multiplexed error-robust FISH) 空间转录技术【3】构建了小鼠前额叶皮层和其附近皮层的细胞图谱,系统的研究了不同神经细胞亚型的分布特征和分子组成,并

brainnew神内神外 - 疼痛,前额叶皮层,张毅,空间转录组技术 - 2023-11-04

J Ethnopharmacol:综合代谢<font color="red">组</font><font color="red">学</font>和<font color="red">转录</font><font color="red">组</font>学分析,揭示苍术油对脾阳虚证大鼠的影响

J Ethnopharmacol:综合代谢转录学分析,揭示苍术油对脾阳虚证大鼠的影响

结合代谢转录学分析,揭示苍术油对脾阳虚证大鼠的改善作用及其机制。

MedSci原创 - 肝脏,代谢组学,转录组学,AMPK/SIRT1/PGC-1α,苍术油,脾阳虚证 - 2023-09-26

Nature子刊 | 范骁辉/陈华钧/高月团队开发<font color="red">空间</font>解卷积算法Bulk2Space,将Bulk<font color="red">转录</font><font color="red">组</font>重构至单细胞<font color="red">空间</font>分辨率

Nature子刊 | 范骁辉/陈华钧/高月团队开发空间解卷积算法Bulk2Space,将Bulk转录重构至单细胞空间分辨率

Bulk2Space具有很好的生物和临床应用前景,包括揭示细胞的空间特异性变异,发现新基因的空间表达模式,实现更精细的细胞聚类,预测分子疾病进展的潜在机制等。

测序中国 - Bulk2Space,Bulk转录组,单细胞空间分辨率 - 2022-11-26

Circulation:血浆蛋白质<font color="red">组</font>学联合单细胞<font color="red">转录</font><font color="red">组</font><font color="red">学</font>“排序”心梗后心衰标志物

Circulation:血浆蛋白质学联合单细胞转录“排序”心梗后心衰标志物

心力衰竭(HF)是急性心肌梗死(MI)的最常见的远期并发症。了解与MI后HF相关的血浆蛋白及其基因表达可能会为发现生物标志物和药物靶标确定新的候选对象。

MedSci原创 - 心肌梗死,心力衰竭,蛋白质组学,生物标志物,单细胞转录组学 - 2020-10-15

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